无法将ggplot图保存为PDF文件怎么办

serif代表Times New Roman字体,sans代表Arial字体,mono代表Courier New字体。这种映射关系在基础绘图系统和ggplot2系统中均可使用。

既然字体找不到,那么就导入我们电脑的字体咯:

# 这个代码只需运行一次
extrafont::font_import()

然后你就会看到大量的字体,被从内置区域,搬运到R 目录下

然后就是在保存之前,加载字体

extrafont::font_import()

extrafont::loadfonts()

使用 ggsave 函数ggplot2 提供了 ggsave 函数来保存图形。确保你使用了正确的语法:

R 复制代码
ggsave("plot.pdf", plot = your_plot_object, device = "pdf")

检查图形设备:在某些情况下,图形设备可能没有正确打开或关闭。你可以尝试显式地打开和关闭设备:

pdf("plot.pdf")
print(your_plot_object)
dev.off()

CairoPDF() 是一个替代方案,它更好地处理了字体渲染和跨平台问题。为确保 CairoPDF 正常工作,请确保正确使用单位并且关闭图形设备 (dev.off())。

正确使用 CairoPDF() 保存图像

复制代码

r

Copy code

# 使用 CairoPDF 保存图像 Cairo::CairoPDF("1.5Merge_volcano_gene_plot.pdf", width = 4, height = 3.5) # 绘制您的图形 print(p) # 关闭设备 dev.off()

关键点:
  • 确保在使用 CairoPDF 或其他 Cairo 设备时,调用 print(p) 以实际生成图形。
  • 最后调用 dev.off() 来关闭图形设备,确保文件正确保存。

关于单位:

CairoPDF() 并不需要 units='in' 这种参数,因为 widthheight 默认是以英寸为单位。

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