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ESI-MS 提供分子量"身份证明"：
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作用： ESI-MS 精确测定样品中所有 带电离子的质荷比（m/z），从而得到整体样品的平均分子量。
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结果解读： 如果测得的分子量（通常是单电荷或多电荷状态下的分子量计算出的平均分子量）与目标多肽的理论分子量精确匹配（通常在允许的误差范围内，如 ±0.5-1 Da 或更小），这强有力地证明：
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样品中存在具有目标氨基酸序列的分子（即目标多肽链）。
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目标多肽是样品中的主要成分（因为主峰信号通常最强）。
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局限性： ESI-MS 无法区分 具有相同分子量 但结构不同的化合物。例如：
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异构体： 序列异构体（如两个氨基酸顺序互换）、构象异构体（如顺反异构）。
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共洗脱杂质： 如果小杂质峰在ESI-MS进样时与主峰一起进入质谱，并且其信号被主峰掩盖，或者其分子量恰好与目标相同（可能性较低），ESI-MS可能无法单独识别它。你的样品在HPLC上已经分开了，但做ESI-MS时通常进的是混合样或者只选了主峰做（后面会讲）。
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非共价复合物： 目标多肽可能与溶剂分子、盐离子等形成非共价复合物，在特定条件下也可能产生信号。
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HPLC 提供纯度和分离信息：
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作用： HPLC根据多肽与固定相和流动相之间的相互作用力（疏水性、电荷、大小、形状等）进行分离。不同的化合物具有不同的保留时间。
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结果解读： 观察到单一的主峰通常被认为是高纯度的标志。出现小峰（次峰）表明存在杂质。
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局限性： HPLC 本身不能直接确定某个峰对应的具体分子结构是什么。保留时间相同不等于结构相同（虽然可能性很小），保留时间不同也不一定分子量就不同（比如异构体）。
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如何协同判断主峰是目标多肽？
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ESI-MS确认目标分子量存在于样品中： 这是最基础的一步。如果ESI-MS显示分子量不是目标值，那么无论HPLC什么样子，目标物都不纯或者不是目标物。
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HPLC主峰占主导地位： 主峰面积远大于次峰，表明样品的主要成分是某个单一物质。