技术栈

基于序列的分子生成

镰刀韭菜
7 小时前
大语言模型·sas·3dsmiles-gpt·分子设计·基于序列的分子生成·基于骨架的分子生成·vina
【AI4S】3DSMILES-GPT:基于词元化语言模型的3D分子生成基于目标结构生成三维(3D)分子,是药物发现领域的一项前沿挑战。然而,目前许多现有方法往往会产生构型无效、不符合物理实际、药效不佳、合成难度大,且耗时较长的分子。为应对这些难题,我们提出了3DSMILES-GPT——一种完全由语言模型驱动的3D分子生成框架,该框架仅使用标记符进行操作。我们将二维(2D)和三维分子表示均视为语言表达形式,通过全维表示将其有机结合,并在包含数千万种类似药物分子的海量数据集上对模型进行预训练。这种纯标记符的方法使模型能够全面理解大规模分子的二维与三维特性。随后,我们利用蛋白质口
我是有底线的