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表观转录组学

H3N4Y
1 天前
表观转录组学·par-clip-seq·#rna结合蛋白·蛋白质与rna相互作用·转录后调控·t-c转换·4su标记
PAR-CLIP-seq :描绘RNA-蛋白质相互作用图谱PAR-CLIP-seq(Photoactivatable Ribonucleoside-Enhanced Crosslinking and lmmunoprecipitation sequencing)即基于光活化核糖核苷的交联和免疫沉淀测序技术[1],将具有光活性的核糖核苷类似物4sU掺入到新转录的RNA中,再通过分析碱基T-C转换位点,可在全转录组范围内研究RNA与蛋白的相互作用,揭示靶向RBP的RNA结合位点。
H3N4Y
8 天前
m1a·rna甲基化·m1a-seq·表观转录组学·翻译调控·肿瘤代谢·多组学关联分析
m1A-seq:RNA m1A甲基化修饰测序N1-methyladenosine(m1A)是一种重要的RNA转录后修饰,是RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰,首次报道是在50多年前[1]。2016年,何川等人[2]发现m1A对甲基化mRNA的翻译具有促进作用,存在于多种不同的真核细胞基因转录本中,包括酵母菌到哺乳动物,使我们重新认识m1A。越来越多的研究发现,m1A不仅影响局部RNA结构、蛋白-RNA相互作用以及5’UTR的翻译,还存在于tRNA、rRNA、mRNA和线粒体转录本[3],在维持这些ncRNA的正确结构和功能上发挥重要的作用[
我是有底线的