技术栈

脚本化

Blockbuater_drug
3 小时前
分子对接·dock·共价对接·脚本化·covalent
UCSF DOCK 分子对接详细案例(06)- 共价分子对接摘要:本文把 Rizzo Lab 的 DOCK6 共价对接教程(5VKG/tenatoprazole 案例)全部 6 节 GUI 手工操作脚本化,避免繁琐的窗口操作,适合共价分子的大规模虚拟筛选。步骤包括:受体准备、配体准备、sphere/box/grid/docking 全部收敛为两条命令,换体系只需改 5 个参数。文中给出完整可复现的系列脚本与输入输出案例文件,并记录 8 条 DOCK 6.11 与老教程参数文件、obabel 输出格式的兼容性踩坑,全部实测复现。
我是有底线的