技术栈
seurat
蜡笔小新..
2 个月前
python
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seurat
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scanpy
ScanPy - Preprocessing and clustering 3k PBMCs (legacy workflow)工作复现
话不多说先上官网：由于之前已经对Seurat中的10x Genomics数据集的教程进行了复现，所以这篇文档只是参考官方教程来进行撰写的，会加入自己的理解以及教程中没有涉及到的扩展的内容，本文的代码会使用大模型来添加注释，每段代码都会加注释方便学习和理解。
蜡笔小新..
2 个月前
数据库
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学习
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r语言-4.2.1
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seurat
Seurat - Guided Clustering Tutorial官方文档学习及复现
由于本人没有使用过Seurat4.0，而是直接使用的最新版。所以本文都是基于Seurat5.2.0（截止2025/3/6）来进行撰写。
Young.Dr
1 年前
seurat
VlnPlot画的其实不是原始数据
昨天的推文描述了让小提琴图肚子变大的做法：让你的小提琴肚子大起来在此说明：这种不考虑后果，就让肚子大起来的做法是不严谨的。如需使用，建议将原始图和修改图放在一起对比，且在文章中注明。因为我们去掉0之后就改变了本身的数据分布