技术栈
分子生成
wufeil
1 个月前
深度学习
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分子生成
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药物设计
相互作用感知的 3D 分子生成 VAE 模型 - DeepICL 评测
DeepICL 是一个基于相互作用感知的 3D 分子生成模型，能够在目标结合口袋内进行相互作用引导的小分子设计。DeepICL 通过利用蛋白质-配体相互作用的普遍模式作为先验知识，在有限的实验数据下也能实现高度的泛化能力。
Blockbuater_drug
8 个月前
linux
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数据库
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cnn
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开源
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分子生成
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药物设计
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deepfrag
机器学习开源分子生成系列(1)-DeepFrag的本地部署及使用
本文提供了开源程序DeepFrag的在本地conda版本的部署及使用方法，满足用户避免数据上传到web app使用。
Blockbuater_drug
8 个月前
数据库
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分子生成
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分子对接
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dock
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从头设计
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片段库生成
UCSF DOCK 分子对接详细案例（03）-分子从头设计de novo Design
本文是UCSF DOCK的使用案例分享，包括DOCK 6.11的de novo Design 模块包含的三项功能： （1）Generic de novo design （2）De Novo Refinement （3）用户自定义生成片段库并实现Focused De Novo Design
wufeil
10 个月前
深度学习
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stable diffusion
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分子生成
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药物设计
Stable Diffusion架构的3D分子生成模型 GeoLDM - 测评与代码解析
之前，向大家介绍过3D分子生成模型 GeoLDM。GeoLDM按照Stable Diffusion架构，将3D分子生成的扩散过程运行在隐空间内，优化了基于扩散模型的分子生成。可能是打开Drug-AIGC的关键之作。让精确控制分子生成有了希望。