gwas

生信分析笔记

全基因组关联分析(GWAS)中模型参数选择：MLM、GLM与FarmCPU的深度解析全基因组关联分析(GWAS)是识别与复杂性状相关的遗传变异的重要工具。然而，模型选择不当会导致假阳性率升高或统计功效降低。本文将为大家介绍GWAS中如何选择合适的模型参数，重点解析广义线性模型(GLM)、混合线性模型(MLM)和FarmCPU三种主流模型的原理、区别、使用技巧及适用场景，并提供实际应用案例。

橙子牛奶糖

GWAS：plink进行meta分析之前教程提到过Metal是可以做Meta分析，除了Metal，PLINK也可以进行Meta分析。命令如下所示：

[GWAS]plink基因数据性别质控并用R作图不太熟悉plink的朋友先去熟悉一下它的一些用法 plink常用参数→