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橙子牛奶糖2 天前
算法·gwas·生物信息学·单细胞测序
Science | 本周最新文献速递中文标题: 揭秘细胞如何感知硬度!发现“机械增强子”调控基因表达与细胞行为的新机制 关键词: 机械转导、基因组增强子、细胞外基质刚度、表观遗传编辑、纤维化
橙子牛奶糖10 天前
gwas·生物信息学·单细胞测序
Cell | 本周最新文献速递文章标题: Multimodal AI generates virtual population for tumor microenvironment modeling 中文标题: AI重磅突破!H&E图像秒变多重免疫荧光,肿瘤微环境建模迈入新纪元! 关键词: 多模态AI、肿瘤微环境、虚拟多重免疫荧光、H&E图像、临床发现 摘要总结: 这篇文章介绍了一种名为GigaTIME的开创性多模态人工智能框架,旨在以前所未有的群体规模对肿瘤免疫微环境(TIME)进行建模。GigaTIME利用先进的深度学习技术,能够
橙子牛奶糖21 天前
gwas·生物信息学·单细胞测序
2025-11-27-Nature Genetics 本周最新文献速递文章标题: Spatially resolved multi-omics of human metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 中文标题: 揭秘肝病:多组学与空间生物学如何重塑肝脏微环境 关键词: MASLD、空间多组学、脂质相关巨噬细胞、MITF、肝纤维化 摘要总结: 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)是全球慢性肝病的主要原因,其病理生理机制复杂且空间异质性显著。这篇文章通过对61例人类肝脏样本(包括对照组、代谢功能障碍
橙子牛奶糖2 个月前
gwas·生物信息学·单细胞测序
Nature | 本周最新文献速递文章标题: A pangenome and pantranscriptome of hexaploid oat
追风少年ii2 个月前
gwas·空间·单细胞·snp
内容补充--空间转录组联合GWAS数据分析
生信分析笔记5 个月前
gwas·生物信息
全基因组关联分析(GWAS)中模型参数选择:MLM、GLM与FarmCPU的深度解析全基因组关联分析(GWAS)是识别与复杂性状相关的遗传变异的重要工具。然而,模型选择不当会导致假阳性率升高或统计功效降低。本文将为大家介绍GWAS中如何选择合适的模型参数,重点解析广义线性模型(GLM)、混合线性模型(MLM)和FarmCPU三种主流模型的原理、区别、使用技巧及适用场景,并提供实际应用案例。
橙子牛奶糖2 年前
gwas·生物信息
GWAS:plink进行meta分析之前教程提到过Metal是可以做Meta分析,除了Metal,PLINK也可以进行Meta分析。 命令如下所示:
Gremmie20032 年前
r语言·plink·gwas
[GWAS]plink基因数据性别质控并用R作图不太熟悉plink的朋友先去熟悉一下它的一些用法 plink常用参数→
我是有底线的