技术栈
scrna-seq
Biomamba生信基地
12 天前
r语言
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单细胞测序
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scrna-seq
R语言scRNA-seq去RNA污染手册
基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）已能够在单次实验中对数十万个细胞的转录组进行定量分析。这项技术为理解正常和病理性细胞行为的最新进展提供了支撑。此外，构建“人类细胞图谱”的大规模研究工作，关键依赖于基于液滴的scRNA-seq所产生的转录组读数的准确性和细胞特异性。基于液滴的scRNA-seq的核心假设是：每个进行分子标记和逆转录的液滴仅包含来自单个细胞的信使RNA（mRNA）。但在实际应用中，这一假设常被违背，可能导致scRNA-seq数据的解释出现偏差。典型例子包括含有多个细胞的液滴（双
ersanshi055
1 年前
单细胞
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scrna-seq
单细胞入门（2）-经典案例分析
Seurat、dplyr、libr.。Seurat介绍：Analysis, visualization, and integration of Visium HD spatial datasets with Seurat • Seurathttps://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html
生信小鹏
1 年前
人工智能
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学习
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免疫治疗
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scrna-seq
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scrna
Nature旗下 | npj Digital Medicine | 图像+转录组+临床变量三合一，多模态AI预测化疗反应，值得复现学习的完整框架
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我是有底线的