R语言【paleobioDB】——pbdb_collections_geo()：从PBDB获取根据地理位置信息筛选的采集号的基本信息

ALittleHigh2024-01-13 12:25

Package paleobioDB version 0.7.0

paleobioDB 包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDB v1 API。

可以选择在Index of /src/contrib/Archive/paleobioDB (r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。

Usage

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pbdb_collections_geo (...)

Arguments

参数【...】：可通过 API 调用的参数。所有可用参数详见 PBDB Data Service: Single fossil collection。

Value

根据参数发起请求，返回筛选后的采集号的基本信息，生成一个数据帧。

Example

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> pbdb_collections_geo (vocab="pbdb", lngmin=0.0, 
+                       lngmax=15.0, latmin=0.0, latmax=15.0, level=2)
      bin_id record_type n_colls n_occs       lng       lat
1:1  2090048         clu      11     97  1.406183  6.427360
1:2  2090050         clu       1      1  1.520000 11.490000
1:3  2091048         clu      10    351  3.145236  6.561719
1:4  2092047         clu       1      1  5.504167  5.036111
1:5  2092051         clu       4      6  5.614556 13.443914
1:6  2093045         clu       1      3  6.742000  0.317000
1:7  2093047         clu      30    542  7.542572  5.406494
1:8  2093048         clu      29    215  7.474400  6.439259
1:9  2094045         clu      48    167  9.512556  0.422020
1:10 2094046         clu       1      1  9.569167  3.939444
1:11 2094047         clu      76    419  9.242912  4.647558
1:12 2094048         clu      27    115  8.305247  6.624198
1:13 2094049         clu       8     25  9.146875  8.316042
1:14 2094052         clu      26     38  8.852725 14.970588
1:15 2095046         clu       2     41 10.043000  3.922500
1:16 2095047         clu       1     10 10.000000  4.000000
1:17 2095049         clu      43    204 11.168333  9.450814
1:18 2095050         clu      54    271 11.335968 10.629015
1:19 2096049         clu       7     19 13.103489  9.452363
1:20 2096050         clu       1     12 12.740000 10.162222
1:21 2096051         clu      25    630 13.145000 12.076944
2    2097049         clu       9     35 14.662556  8.343245

Page

R 复制代码

function (...) 
{
    l <- list(...)
    .pbdb_query("colls/summary", query = l)
}