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[Tumor Infiltrating Leukocytes(肿瘤浸润性白细胞)](#Tumor Infiltrating Leukocytes(肿瘤浸润性白细胞))
Tumor Infiltrating Leukocytes(肿瘤浸润性白细胞)
该文献收集了肿瘤浸润白细胞marker。鉴定了 60 个标记基因的列表,其表达水平测量 14 个免疫细胞群。
Results of TCGA data evaluation of candidate cell type markers
Cell type | # Candidate genes | # Selected markers | Mean pairwise similarity statistic in TCGA | Selected marker genes |
---|---|---|---|---|
B-cells | 34 | 9 | 0.59 | BLK, CD19, FCRL2, MS4A1, KIAA0125, TNFRSF17, TCL1A, SPIB, PNOC |
CD45 | 1 | 1 | aNA | PTRPC |
Cytotoxic cells | 18 | 10 | 0.69 | PRF1, GZMA, GZMB, NKG7, GZMH, KLRK1, KLRB1, KLRD1, CTSW, GNLY |
DC | 7 | 3 | 0.46 | CCL13, CD209, HSD11B1 |
Exhausted CD8 | 5 | 4 | 0.44 | LAG3, CD244, EOMES, PTGER4 |
Macrophages | 33 | 4 | 0.71 | CD68, CD84, CD163, MS4A4A |
Mast cells | 31 | 5 | 0.74 | TPSB2, TPSAB1, CPA3, MS4A2, HDC |
Neutrophils | 32 | 7 | 0.48 | FPR1, SIGLEC5, CSF3R, FCAR, FCGR3B, CEACAM3, S100A12 |
NK CD56dim cells | 14 | 4 | 0.40 | KIR2DL3, KIR3DL1, KIR3DL2, IL21R |
NK cells | 36 | 3 | 0.47 | XCL1, XCL2, NCR1 |
T-cells | 13 | 6 | 0.81 | CD6, CD3D, CD3E, SH2D1A, TRAT1, CD3G |
Th1 cells | 27 | 1 | aNA | TBX21 |
Treg | 18 | 2 | aNA | FOXP3 |
CD8 T cells | 35 | 2 | 0.51 | CD8A, CD8B |
CD4 cells | 20 | 0 | bNA |
白细胞是一类细胞,也称为免疫细胞或白血球,是人体免疫系统的主要成分之一。 白细胞可以分为粒细胞和淋巴细胞两大类。 粒细胞包括中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞,主要负责对外来病原体及其代谢产物进行吞噬和消化。 淋巴细胞包括T细胞、B细胞和NK细胞,主要负责对身体内的癌细胞、病原体及其代谢产物进行免疫识别和攻击。
TISCH2数据库收录的TIL
肿瘤微环境肿瘤的细胞包括,免疫细胞、基质细胞和恶性细胞
在肿瘤微环境中,基质细胞、髓样细胞和淋巴细胞是重要的细胞类型,它们在肿瘤发展和免疫应答中发挥着关键的作用。
基质细胞是指组织中的支持细胞,包括纤维母细胞、内皮细胞、成血管细胞等。它们主要存在于肿瘤周围的基质中,形成肿瘤的结构支持。基质细胞通过产生胶原蛋白、弹力纤维和其他基质分子,形成肿瘤的基质骨架。此外,基质细胞还参与调节肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭能力,以及血管生成过程。
髓样细胞是一类具有多能性的细胞,包括间充质干细胞和骨髓间质细胞。它们存在于骨髓和其他组织中,并参与肿瘤微环境的调节。髓样细胞通过产生多种细胞因子和信号分子,调控肿瘤细胞的增殖、分化和存活。此外,髓样细胞还可以促进肿瘤的血管生成,提供肿瘤生长所需要的营养和氧气。
淋巴细胞是免疫系统中的重要细胞类型,包括B淋巴细胞、T淋巴细胞和自然杀伤细胞。它们在肿瘤免疫应答中发挥着关键的作用。B淋巴细胞产生抗体,参与体液免疫反应;T淋巴细胞通过识别和杀伤肿瘤细胞,参与细胞免疫反应;自然杀伤细胞则直接杀伤肿瘤细胞。淋巴细胞通过产生细胞因子和调节其他免疫细胞的活性,协调和调控肿瘤免疫应答。 综上所述,肿瘤微环境中的基质细胞、髓样细胞和淋巴细胞分别具有不同的细胞类型和作用。它们相互作用、相互调控,共同参与肿瘤的发展和免疫应答过程。
免疫细胞的分类
科普 | 免疫细胞全家福,了解一下 - 知乎 (zhihu.com)
绝大多数免疫细胞由造血干细胞分化而来。按其分化方向分为两大类:淋巴样干细胞和髓样干细胞。
淋巴样干细胞可以分化为三大类:T淋巴细胞,B淋巴细胞和NK细胞。
髓样干细胞则可以分化为中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞、单核-巨噬细胞、树突状细胞、肥大细胞等。
28种不同免疫细胞类型
该文献研究了 28 种不同免疫细胞类型(免疫组)浸润肿瘤的时空动力学。发现免疫浸润组成在每个肿瘤阶段都发生了变化,并且特定细胞对生存有重大影响。T滤泡辅助性(Tfh)细胞和先天细胞的密度增加,而大多数T细胞密度随着肿瘤的进展而降低。B细胞是核心免疫网络中的关键参与者,与延长生存期有关,其数量在晚期增加,并显示出对复发和肿瘤进展的双重影响。
参考文献:
1:Gene expression markers of Tumor Infiltrating Leukocytes | Journal for ImmunoTherapy of Cancer (bmj.com)
2:Spatiotemporal dynamics of intratumoral immune cells reveal the immune landscape in human cancer - PubMed (nih.gov)