conda安装rpy2,安装R语言,并且打开.rds文件

1.在新环境或者创建好的环境中安装rpy2

bash 复制代码
activate new_ev
conda install rpy2

2.安装R语言

在R语言官网中下载,https://www.r-project.org/

具体安装R语言可看安装R语言

3.R语言和rpy2安装后,配置环境变量

  • path中添加R语言的安装位置

    一定要在系统变量中添加,避免不必要的麻烦

  • 新建R_HOME和R_USER环境变量

    R_HOME是R语言的安装地址

    R_USER是rpy2的安装地址

    如果配置好环境变量后,pycharm仍提示R_HOME未找到R_HOME must be set in the environment or Registry,关闭Pycharm,重新打开Pycharm。

    如果提示OSError: cannot load library 'D:\Program Files\R\R-4.0.3\bin\x64\R.dll': error 0x7e,说明R_HOME的环境变量位置不对。重新配置环境变量,再重新打开Pycharm。

4.使用python打开.rds文件

python 复制代码
import rpy2.robjects as robjects

path = './data_to_anan/dataset1/test.rds'
readRDS = robjects.r['readRDS']
file = readRDS(path)
colnames = robjects.r['colnames']
print(file)
print(colnames(file))

path = './data_to_anan/dataset1/test.rds' 加载你本地文件的地址

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