文章目录
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- [开始上手AutoDock - 从零开始的分子对接软件安装指南](#开始上手AutoDock - 从零开始的分子对接软件安装指南)
- AutoDock下载
- AutoDock完整安装流程
- 常见AutoDock安装问题解决
开始上手AutoDock - 从零开始的分子对接软件安装指南
最近有不少朋友问我怎么弄autodock下载安装 的事，确实这款软件在分子对接研究中算是标配了。今天我就直接上手操作，给大家录制了这篇超简单的autodock安装教程，按照下面步骤来，绝对一次成功！我自己装了好几台电脑，都没出过问题。对了，这个软件主要用于药物筛选和分子对接，如果你是生物信息或药学专业，这个工具真的挺好用的。
安装前先把电脑里的杀毒软件都关了，不然可能会误报拦截安装过程。我之前就栽在这上面，搞了半天才发现是360在后台默默拦截...
AutoDock下载
https://pan.quark.cn/s/a978f1badf21
AutoDock完整安装流程
安装分三大块：Python环境、AutoDock主程序和MGLtools辅助工具。缺一不可，都得装好才能正常使用。
第一步：安装Python环境
软件依赖Python 2.7，这个版本虽然有点老但是兼容性好，专门为这种科研软件准备的。
1、找到安装包里的"python-2.7.11.amd64"，右键点击安装：
2、选"Install for all users"，点"Next"：
3、安装路径千万别改！直接下一步：
4、记得勾选"Add python.exe to Path"，这步很关键：
5、等它安装完：
6、完成后点Finish：
7、接下来设置环境变量，右击此电脑-属性：
8、找到"高级系统设置"点进去：
9、点"高级-环境变量"：
10、找到系统变量里的Path，点编辑：
11、点新建，添加这两个路径"C:\Python27"和"C:\Python27\Scripts"：
12、按Win+R，输入cmd打开命令提示符：
13、输入"python --version"测试一下，看到版本号就是成功了：
第二步：安装AutoDock主程序
有了Python基础，就可以安装主角autodock了。
1、找到"autodocksuite-4.2.6.i86Windows"，右键用管理员身份运行：
2、安装路径可以改，但记得别用中文路径，我一般装D盘：
3、等它装完，点Close就行：
第三步：安装MGLtools可视化工具
最后一步，装MGLtools，这个是用来可视化分子对接结果的，少了它就看不到直观效果。
1、找到"mgltools_win32_1.5.7_Setup"，同样管理员身份运行：
2、一路Next：
3、同意协议，点Yes：
4、安装路径千万别改，直接Next：
5、等它安装：
6、弹窗点OK：
7、取消第一个选项，勾选第二三个，点Finish：
8、这时桌面会出现四个图标，分别是不同功能模块：
- PMV：查看分子结构的
- AutoDockTools (ADT)：主要的对接工具
- Raccoon：批量筛选用的
- Vision：工作流管理工具
我平时用得最多的就是AutoDockTools，基本够用了。
最后一步：配置AutoDock路径
最后一步是配置一下软件路径，让各个组件能互相找到对方。
1、在D盘新建个"Autodock-setting"文件夹：
2、从AutoDock安装目录找到这两个程序，复制到刚才新建的文件夹里：
3、从MGLTools目录找到"adt"文件夹，也复制过去：
4、打开桌面的AutoDockTools，点File-preferences-set，把刚才的文件夹路径粘贴到startup directory，再点make default：
OK，大功告成！整个autodock安装过程就这么简单。虽然步骤看着多，但跟着做一遍就能搞定。下次启动直接点桌面上的AutoDockTools图标就能用了。
常见AutoDock安装问题解决
在安装过程中，有几个坑我自己也踩过，给大家提个醒：
- 如果出现"无法找到Python"的错误，检查环境变量是否设置正确
- 安装路径尽量不要有中文和特殊字符，很多科研软件对这个特别敏感
- 如果软件启动后报错，大部分情况是配置文件路径没设好，重新检查一下第四步的路径配置
记住一点，安装科研软件不像装QQ那么简单，耐心点，一步步来就没问题。