手撕深度学习之CUDA并行规约算法(下篇):硬核优化5连击,性能暴涨300%!附开箱即用模板,小白也能秒上手!

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摘要

本文为CUDA并行规约系列文章的下篇,本文介绍了5种并行规约算法的实现,并从硬件的角度对它们进行分析和优化,最终给出一个开箱即用的模板代码及其使用示例。

勘误

首先是一个勘误,在上篇中存在一个拼写错误,线程束的正确单词是Warp而不是Wrap,非常抱歉给读者朋友们造成了误解。

写在前面

这是本系列文章的下篇。上篇介绍了一些CUDA并行规约优化涉及到的GPU硬件知识,并给出了两种并不完美的实现。

本文将接着介绍剩下的五种实现,并给出一个开箱即用的CUDA并行规约模板。

算法具体实现(下篇)

V2: Sequential Addressing

先简单回顾一下,在上篇的最后,我们发现V1版本的实现存在Bank Conflict的问题,具体表现为,当\(s=32\)时,\(T_0\)会访问\(A_0\),\(T_1\)会访问\(A_{32}\),\(T_2\)会访问\(A_{64}\).....,造成一个Warp里所有线程都同时访问Bank 0,导致这些访问被串行化,严重影响性能。

造成这一问题的根本原因是:同一个Warp里的线程,它们访问的地址存在可变的Stride

Bank机制设计之初的预期就是一个Warp里32个线程访问连续的32个地址,而不是访问分散在各处的地址。

明确了这一点之后,优化方法就很明确了:我们只需要让每个线程都负责其threadIdx对应的内存地址的规约 即可,比如\(T_0\)就只管\(A_0\),\(T_1\)就只管\(A_1\),这样就不会出现Bank Conflict了。

由于要防止Warp Divergence,所以第一轮循环只有前一半线程在工作,以\(n=512\)为例,第一轮循环只有\(T_0\)到\(T_{255}\)在工作,那么很显然的,\(T_0\)就需要规约\(A_0\)和\(A_{256}\),\(T_1\)需要规约\(A_1\)和\(A_{257}\),以此类推。这个过程如下图所示:

在代码实现上也不难,只需要做如下改变即可:

一个容易混淆的点

可能会有读者感到疑惑:总会有一次循环,\(T_0\)会访问\(A_0\)和\(A_{32}\),这怎么能算解决了Bank Conflict呢?

这里需要明确的一点是:Bank Conflict是发生在线程间的,而不是一个线程内的指令间的

从指令执行的角度来分析,就以\(A_0 = A_0 + A_{32}\)为例,这条语句会分4步完成,分别是:读取\(A_0\),读取\(A_{32}\),计算\(A_0 + A_{32}\),写入\(A_0\)。

对\(T_0\)而言,读取\(A_0\)和读取\(A_{32}\)一定是先后发生的,不会并行,所以也就不存在Bank Conflict。

这里我们再从线程间执行的角度来看看,在\(T_0\)读取\(A_0\)时,\(T_1\)在读取\(A_1\),这不会发生冲突。但是如果是V1的实现,在\(T_0\)读取\(A_0\)时,\(T_1\)可能会同时在读取\(A_{32}\),这就导致了Bank Conflict。

优化效果

根据NVIDIA的数据,这一优化将性能提升了接近1倍,也是相当可观的。

V3: First Add During Load

V2版本已经把硬件上踩过的坑基本都填完了,接下来就是一些细节上的优化。其中有一个思路就是在把数据加载到共享内存的阶段做一些预处理。

比如,我们可以先把\(A_0\)和\(A_1\)规约了,然后存储到\(A_0\)中,把\(A_2\)和\(A_3\)规约了,存储到\(A_1\)中。这样就只需要启动一半的线程,以几乎一半的时间执行完所有的任务。

这一想法还可以进一步推广,如果在加载阶段就提前规约4个元素,那就可以把时间压缩到\(\frac{1}{4}\)。

这一思想就是所谓的算法级联,即结合并行执行和串行执行的策略。这部分更详细的会在后面V6版本里分析。

由于这里NVIDIA的实现和我们的问题定义有冲突,这里就不详细展开了,仅贴出NVIDIA的实现供参考。

实测的数据也验证了这一理论的正确性,时间确实缩短了接近一半。

V4: Unroll the Last Warp

V3版本计算出的有效带宽为17GB/s,远没有达到硬件的上限,所以有理由怀疑这里还存在指令执行上的瓶颈。

观察之后发现,这里的部分循环指令也许可以优化掉。在上篇中,我们提到过:在同一个Warp里,指令执行可以认为是同步的,所以我们可以在最后32个线程工作时去掉__syncthreads

此外,既然都已经知道这里是最后32个线程在工作了,那循环也不必需要了,可以直接硬编码写\(T_i = A_i + A_{i+32}\),\(T_i = A_i + A_{i+16}\),......,最终的修改如下图所示

为什么不需要线程同步了?

因为这里可以保证进入warpReduce的线程是\(T_0\)到\(T_{31}\),即一个Warp内的线程。

根据之前的内容,\(T_0\)在执行函数第二行\(A_0 += A_{16}\)时,\(T_{16}\)是一定也在执行第二行,换言之,\(T_{16}\)是一定执行完成了第一行的,这就保证了在执行取\(A_{16}\)这个指令时,\(A_{16}\)存储的一定是规约了\(A_{16}\)和\(A_{48}\)之后的值

那么还有一个疑问:这里\(T_{16}\)写入了新的\(A_{16}\)的值是\(A_{16} + A_{32}\),这不就破坏了整个规约过程了吗?

事实上,这里\(T_{16}\)写入了什么并不重要,这是基于两点事实:

首先,\(T_{16}\)写入\(A_{16}\)和\(T_0\)写入\(A_0\)一定是在同一个时钟周期内发生的,所以在一开始执行第二行时,\(T_0\)读取到的\(A_{16}\)一定是没被破坏的\(A_{16}\),这确保了\(T_0\)执行的正确性

其次,在执行完第一行之后,实际上只有\(T_0\)到\(T_{15}\)真正起作用了,后面16个线程只要不乱写数据妨碍到前16个线程的工作,无论做什么都对结果没影响

所以理论上讲,这里加个判断,只让\(tid < 16\)的线程执行,最终的结果都是正确的。这里没有这么做主要是为了防止Warp Divergence。

优化效果

实验数据表明,仅仅是对最后一个Warp做了循环展开,最终性能就优化了接近一倍。

V5: Completely Unrolled

既然只对最后一个Warp进行循环展开优化就这么明显,那能不能再激进一些,把所有循环都丢掉呢?

答案是Yes。

因为一个线程块内的线程数量上限是1024,并且我们要求线程数量是2的整数次幂,所以我们可以枚举所有可能的线程数量,然后仿照之前展开最后一个循环的方法,针对每种情况直接写出对应的展开后的代码。

如果只是在参数列表里加一个blockSize,那么在运行时还是会经过多个无意义的if-else,影响执行效率。这里可以借助C++的模板机制,进一步地提升执行性能。具体的修改如下图所示:

这里的blockSize是在调用时使用模板传递的,这里面的if会在编译时就进行优化。

编译器会使用Dead Code Elimination,根据blockSize删掉不可达的代码,所以最终编译出的二进制里面是不会有这些红色的if的,只有一串顺序执行的指令。

但是模板要求我们在编译阶段就确定blockSize,在实际实现时是比较困难的,这个该如何解决呢?答案是在调用时使用switch来枚举,简单粗暴,如下图所示:

优化效果

V6: Multiple Adds

理论分析

这里我们要从成本的角度来看待一下现有的方案。

和我们租用算力服务器一样,成本可以用使用时间 * GPU核心数量 来衡量,这里GPU核心数量可以认为是线程数量,两者之间只有常数倍的差别。

我们假设这样一个场景来计算成本:

  • 只有1个Batch,共有\(N\)个元素
  • 启动\(P\)个线程来处理,在V5实现中,\(P=N\)

这里使用Brent定理:

\[t(n)=O\left(\frac{W(n)}{p} + T(n)\right) \]

其中\(t(n)\)为算法的估计实际执行时间;\(W(n)\)表示算法的总工作量,即一共执行多少次运算;\(p\)表示线程数量;\(T(n)\)表示算法在最理想的情况下,算法执行的最短用时

很显然,这里\(p=N\);由于最少也需要执行\(\log N\)步规约,所以\(T(n)=\log N\);一通计算可以得到,\(W(n)=O(N)\),这里具体计算过程见NVIDIA的PPT,这里不再赘述。

带入公式可得,\(t(n)=O(\log N)\)

那么可以计算得到,V5版本算法的成本为\(O(N \log N)\)。

但是如果用一个线程串行处理所有数据,成本却只有\(O(N)\),也就是说,我们的并行算法的成本比纯串行处理还要高。那么怎么把这个成本降下来呢?

这里成本变高的本质是:线程数量过多,使得每个线程的工作量太少,导致了整体成本的增大。

那么相对应的,我们可以通过减少线程数量来实现降本增效。具体来说,我们可以使用V3中提到的方法,即在加载数据的阶段就提前做几次规约。

那么具体应该做多少次呢?这里NVIDIA的PPT里给出的数据是应该做\(\log N\)次,如此优化之后,最终的成本能降到\(O(N)\),可以和串行执行持平。

这里把串行和并行搭配使用的策略就是算法级联

实现方式

这里NVIDIA的实现和我们的问题定义相冲突,所以这里不再赘述了,后面在开箱即用的部分会解释我们是如何处理这一冲突的。

下图是V5到V6版本的变化以及V6的完整代码实现。

优化效果

这里贴出7个版本的优化效果数据表格:

还能再优化吗?

NVIDIA官方的PPT到这里就结束了。我们可以思考一下:V6版本还能进一步优化吗?

也许还可以,比如用循环展开的技巧和最开始的while循环展开一下,这个就作为open issue供大家探讨了。

开箱即用的实现

数据要求

  • 输入:\(m \times n\)矩阵按行优先展开成的一个向量\(x\)
  • 输出:\(m\)维向量\(out\)
  • 要求线程块内线程的数量(block_size) \(\leq 1024\),并且为2的整数次幂
  • 要求\(n\)一定要能整除block_size

NVIDIA官方的实现里似乎没有batch的概念,感觉是想要把输入的所有数据都规约到一个值,因此在V3和V6里面会有跨Block规约的情况。

我们这里就不采用这个方案,而是把\(n\)分为了若干个fold,最终的线程数量就是 \(\frac{n}{\text{fold_num}}\),在一开始加载数据时就提前规约fold_num次。这个fold_num由调用方传递。

对于一个batch数量大于1024的情况,和数据数量不是2的整数次幂的情况,则需要调用CUDA的上层框架做处理了,这里暂时不考虑这些case。

代码实现

这一实现使用了C++的模板特性,支持调用者自行选择数据类型和规约函数。

cpp 复制代码
template<typename T>
using ReduceFunc = T(*)(T, T);

template<typename T, ReduceFunc<T> reduce_func, size_t block_size>
__device__ void reduceWarp(volatile T *shared_memory, size_t tid) {
  if (block_size >= 64) shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 32]);
  if (block_size >= 32) shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 16]);
  if (block_size >= 16) shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 8]);
  if (block_size >= 8) shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 4]);
  if (block_size >= 4) shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 2]);
  if (block_size >= 2) shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 1]);
}

/**
 * Grid(m, 1, 1)
 * Block(block_size, 1, 1)
 * @tparam T 需要Reduce的数据类型
 * @tparam reduce_func Reduce函数
 * @tparam block_size 一个block里的线程数量,要求一定是2的整数次幂,最多支持1024
 * @param x 输入矩阵,按行优先展开
 * @param out 输出向量
 * @param n 一个batch里的元素数量,要求一定能整除block_size
 */
template<typename T, ReduceFunc<T> reduce_func, size_t block_size>
__global__ void ReduceKernelTemplateFinal(const T *x, T *out, const size_t n) {
  assert(block_size <= 1024);
  assert((block_size & (block_size - 1)) == 0); // 确保n是2的整数次幂
  assert((n & (block_size - 1)) == 0); // 确保n能够整除batch_size
  extern __shared__ T shared_memory[];

  const size_t tid = threadIdx.x;
  const size_t fold_num = n >> __builtin_ctz(block_size); // 这里会直接在编译阶段就展开,更高效
  size_t i = 1;
  size_t last_x_index = blockIdx.x * blockDim.x + tid;
  shared_memory[tid] = x[last_x_index];
  while (i < fold_num) {
    const size_t current_x_index = last_x_index + block_size;
    shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], x[current_x_index]);
    last_x_index = current_x_index;
    i++;
  }

  __syncthreads();

  // 完成加载阶段,开始规约
  if (block_size >= 1024) {
    if (tid < 512) {
      shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 512]);
      __syncthreads();
    }
  }

  if (block_size >= 512) {
    if (tid < 256) {
      shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 256]);
      __syncthreads();
    }
  }

  if (block_size >= 256) {
    if (tid < 128) {
      shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 128]);
      __syncthreads();
    }
  }

  if (block_size >= 128) {
    if (tid < 64) {
      shared_memory[tid] = reduce_func(shared_memory[tid], shared_memory[tid + 64]);
      __syncthreads();
    }
  }

  if (tid < 32) {
    reduceWarp<T, reduce_func, block_size>(shared_memory, tid);
  }

  // 规约完成,写入结果
  if (tid == 0) {
    out[blockIdx.x] = shared_memory[0];
  }
}

template<typename T, ReduceFunc<T> reduce_func>
void InvokeReduceFunc(const T *x, T *out, const size_t m, const size_t n, size_t fold) {
  if (n < fold) {
    fold = 1;
  }
  assert(n % fold == 0);
  size_t block_size = n / fold;
  dim3 grid(m, 1, 1);
  dim3 block(block_size, 1, 1);
  switch (block_size) {
    case 1024:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 1024><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 512:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 512><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 256:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 256><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 128:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 128><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 64:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 64><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 32:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 32><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 16:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 16><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 8:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 8><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 4:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 4><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 2:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 2><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
    case 1:
      ReduceKernelTemplateFinal<scalar_t, reduce_func, 1><<<grid, block, sizeof(scalar_t) * block_size>>>(x, out, n);
      break;
  }
}

使用示例

使用起来还是比较简单的,如下所示:

cpp 复制代码
__device__ inline scalar_t sum_reduce_func(scalar_t x, scalar_t y) {
  return x + y;
}

void ReduceMax(const CudaArray& a, CudaArray* out, size_t reduce_size) {
  /**
   * Reduce by taking maximum over `reduce_size` contiguous blocks.  Even though it is inefficient,
   * for simplicity you can perform each reduction in a single CUDA thread.
   *
   * Args:
   *   a: compact array of size a.size = out.size * reduce_size to reduce over
   *   out: compact array to write into
   *   redice_size: size of the dimension to reduce over
   */
  /// BEGIN SOLUTION
  const size_t fold = 4;
  const size_t m = a.size / reduce_size;
  const size_t n = reduce_size;

  InvokeReduceFunc<scalar_t, max_reduce_func>(a.ptr, out->ptr, m, n, fold);
  /// END SOLUTION
}

结语

CUDA并行计算入门比较容易,但是要做好很难。NVIDIA官方给了一些如何做性能优化的建议,这里贴在下面供大家参考

非常感谢NVIDIA的知识开源,这38页PPT可以算得上一个比较好的并行计算优化的教材了。

以上就是本系列文章的全部内容,很感谢屏幕前的读者朋友能耐心看到现在,希望这些内容能帮到大家,如果大家对文章内容有疑问也欢迎在评论区探讨。