活性多肽是一类由蛋白酶水解或微生物发酵得到的分子量小于1 KDa的肽段。氨基酸组成、排列、亲疏水性等特征决定了多肽的活性，研究表明活性肽具有抗氧化、抗菌、免疫调节、抗癌、降血糖、降压等生理功效。
随着大数据和生物信息学的发展，可以利用AI技术实现蛋白的虚拟水解和活性肽的虚拟筛选，筛选效率嘎嘎快。
虚拟水解 方式制备活性肽：首先需要获取蛋白的氨基酸序列（可以在NCBI数据库检索蛋白序列），在BIOPEP-UWM 数据库 或者PeptideCutter 网站（https://web.expasy.org/peptide_cutter/）中导入蛋白序列后选择所需的蛋白酶（可以选择单一蛋白酶或者复合蛋白酶水解）进行虚拟水解。优势就是水解蛋白序列后直接获得肽段序列，免去了质谱鉴定的过程。
BIOPEP-UWM数据库（https://biochemia.uwm.edu.pl/biopep-uwm/）的使用：首页中选择Bioactive peptides--analysis--ENZYME(S) ACTION--FOR YOUR SEQUENCE--输入蛋白序列-选择合适的蛋白酶--view the report with the results。
对于虚拟水解后得到的肽段进行虚拟筛选 ，一般选择2-10个氨基酸的肽段 ，随后利用计算机算法来筛选活性肽。
使用PeptideRanker 工具（http://distilldeep.ucd.ie/PeptideRanker/）对虚拟水解后获得的多肽序列进行潜在生物活性预测，输入多肽序列后给出评分，评分一般在0-1之间，活性肽一般选评分大于0.5以上的肽段。
使用ToxinPred 3.0工具（https://webs.iiitd.edu.in/raghava/toxinpred3/ prediction.php）在线评价多肽的潜在毒性，默认毒性阈值为0.38。
使用Peptide property calculator（http://www.innovagen.com/proteomics-tools/）在线预测多肽的水溶性。
使用AnOxPePred（https://services.healthtech.dtu.dk/services/AnOxPePred-1.0/）在线预测多肽的抗氧化性。
使用StackDPPIV工具（https://pmlabstack.pythonanywhere.com/ StackDPPIV）在线预测多肽的降血糖活性。
活性肽筛选完成后，可以利用分子对接工具预测大分子和小分子的结合方式、作用方式、作用力大小。分子对接最常用的两个软件AutoDock（半柔性对接）和Discovery Studio（柔性对接）。