windows安装crest-3.0.2-windows和xtb-6.7.1,windows版crest-3.0.2

有两个版本,一个cygwin版本,另一个版本需要添加到系统path环境变量里面

下载: https://pan.baidu.com/s/18kWA-vQEP4_uHm0EkUxz0A?pwd=efak 提取码: efak

Gromacs&Vasp软.件.交.流:962946828

什么是 CREST?

CREST 旨在解决传统量子化学方法在构象搜索中面临的"构象爆炸"和计算资源消耗过大的问题。它利用 GFNn-xTB (如 GFN2-xTB)和 GFN-FF 力场,能够快速、准确地生成分子的低能构象集合。

🚀 核心功能与技术突破

CREST 3.x 系列(包括 3.0.2)在算法和效率上进行了多项重要升级:

1. 智能采样算法 (iMTD-GC)

这是 CREST 的核心。它结合了改进的元动力学 (iMTD)遗传交叉 (GC) 算法。

  • 原理:iMTD 负责在能量面上进行广泛的探索,而 GC 算法则通过组合现有的低能构象来生成新的候选结构。
  • 优势:相比传统分子动力学,采样效率提升约 80%,且能更全面地覆盖构象空间,发现更多低能构象。
2. 多尺度计算框架

CREST 构建了一个完整的工作流,集成了从快速力场计算到高精度量子化学计算的各个环节:

  • 粗粒度筛选:使用 GFN-FF 力场进行快速采样。
  • 精细优化:使用 GFN2-xTB 进行高精度能量计算。
  • 环境模拟:内置溶剂化模型(如隐式水溶剂),能更真实地反映分子在生理条件下的行为。
3. 自适应能量窗口

系统能根据分子的柔性自动调整能量阈值(Energy Window)。

  • 刚性分子:采用较小窗口(如 1.0 kcal/mol)以提高效率。
  • 柔性分子:自动扩大窗口(如 3.0 kcal/mol)以确保不遗漏重要构象。
相关推荐
qq_369224333 天前
Windows全系通用!ntdll.dll文件丢失、报错、闪退问题的完整排查与修复教程
windows·dll·dll修复·dll丢失·dll错误
阿米亚波3 天前
【Windows】QEMU 启动 openEuler aarch64/arm64 架构系统 + 离线软件源
linux·windows·经验分享·笔记·架构·arm
caimouse3 天前
Reactos 第 10 章 网络操作 — 10.3.1 NIC驱动
网络·windows
初圣魔门首席弟子3 天前
Node.js 详细介绍(知识库版)
windows·qt·node.js·知识库
CHENG-JustDoIt3 天前
AI工具 | 爆火开源项目Odysseus AI 工作台:从项目介绍、部署情况及其使用等多方位分析指南(含详细步骤)
大数据·人工智能·windows·python·ai·开源·github
kingbal3 天前
Windows:flutter环境搭建
windows·flutter
未若君雅裁3 天前
Python 数据容器详解,list、tuple、str、set、dict 到底怎么选
windows·python·list
CodeKwang3 天前
Windows 环境 OCCT 8.0 编译构建及与 Qt6 项目集成
windows·qt·opencascade
我是伪码农3 天前
小兔鲜1-25
linux·服务器·windows
vx-Biye_Design3 天前
springboot安阳地区研学旅游服务小程序-计算机毕业设计源码12785
java·vue.js·windows·spring boot·tomcat·maven·mybatis