直接说结论：现代服务器上的主流 PCIe 设备（如 NVMe 盘、高速网卡、GPU/DPU、RAID 卡等），基本都已全面转向 MMIO（内存映射 I/O）访问，不再使用传统的 Port I/O（x86 的 IN/OUT 指令）来做主要数据交互。
不过，PCIe 协议出于向后兼容的考虑，依然保留了对 I/O 空间的支持，所以在特定场景下还能见到"PCIe 设备申请并使用 I/O 端口"的情况，但属于少数遗留或兼容用途。
📌 主流设备：全面使用 MMIO + DMA
现代高性能 PCIe 设备的驱动工作方式通常是：
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MMIO（内存映射 I/O） ：设备把内部寄存器或缓冲区映射到系统物理地址空间（通过 BAR 实现）。CPU 直接用普通内存读写指令（如
MOV）访问这些地址来控制设备，无需专用 I/O 指令，性能好且支持缓存、虚拟化等现代特性。 -
DMA（直接内存访问）：大量数据传输由设备的 DMA 引擎直接在设备与主机内存之间搬运，CPU 只需通过 MMIO 配置一下 DMA 描述符，大幅降低开销。
像 NVMe 固态硬盘、100G/400G 网卡、GPU 加速卡、现代 RAID/HBA 卡等，其高性能路径完全基于 MMIO + DMA，不依赖传统 I/O 端口。
🧰 仍存在 I/O 空间申请的少数情况
虽然功能通信不靠它，但以下场景可能还会见到 PCIe 设备申请 I/O 端口区间（可用 lspci -v看到 I/O ports区域）：
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兼容旧式驱动/接口的设备：比如 PCIe 转串口（UART 16550 兼容）、并口、传统 PS/2 风格设备的桥接卡。它们会映射老式 I/O 端口，以便复用现有传统驱动。
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遗留兼容模式：部分现代显卡会在 PCIe 配置空间申请少量 I/O 端口，只为保留 VGA/VESA 文本模式兼容（做服务器管理/调试用，正常图形或计算走 MMIO/DMA）。某些 SATA 控制器也可能留 IDE 兼容的 I/O端口，但实际数据路径还是 MMIO/DMA。
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BMC/IPMI 管理等辅助芯片：服务器带外的管理控制器（如 ASPEED BMC）虽常挂在 PCIe Root Complex 下，但其简单控制通道有时也会涉及传统 I/O 区域，不过核心通信仍以 MMIO 为主。
📝 总结
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业务面高性能设备（NVMe / 网卡 / GPU） ：✅ 纯 MMIO + DMA，无 Port I/O 访问。
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协议/架构层面：PCIe 仍支持 I/O 空间，但 PCI-SIG 明确建议新设计只用 MMIO，I/O 空间仅为 Legacy 兼容保留。
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实际在服服务器：你一般只会因兼容旧式串口卡、VGA 兜底模式等，才见到 PCIe 设备占用 I/O 端口，不影响主流 I/O 性能路径。
如果你在具体服务器上用 lspci -v看到了某块 PCIe 卡带有 I/O ports，那基本就是在兼容某种老式编程接口，不必担心它成为现代业务数据通路的瓶颈。