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21 天前
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GAMESS 在 Ubuntu 24.04 平台上的编译与配置
GAMESS(General Atomic and Molecular Electronic Structure System) 是一款用于 从头算(ab initio)分子量子化学计算 的程序包。简而言之,GAMESS 可用于计算多种自洽场(SCF)波函数类型,包括 RHF、ROHF、UHF、GVB 和 MCSCF 等。针对这些 SCF 波函数的电子相关修正,GAMESS 提供了多种方法,如 组态相互作用(CI)、二阶微扰理论(MP2)、耦合簇方法(CC),以及 密度泛函理论(DFT) 近似。
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1 个月前
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Amber24 安装指南:Ubuntu 22.04 + CUDA 12.4 环境
Amber 是一个用于分子动力学(molecular dynamics, MD)模拟的软件包,主要用于生物大分子(例如蛋白质、核酸、脂质等)的模拟。研究人员可借助 Amber 探究分子的结构与运动,例如蛋白质折叠或配体结合等生物过程。这个软件已有超过 20 年历史,最近我重做了一次 Amber 的安装过程。
我是有底线的