GAMESS 在 Ubuntu 24.04 平台上的编译与配置

GAMESS简介

GAMESS(General Atomic and Molecular Electronic Structure System) 是一款用于 从头算(ab initio)分子量子化学计算 的程序包。简而言之,GAMESS 可用于计算多种自洽场(SCF)波函数类型,包括 RHF、ROHF、UHF、GVB 和 MCSCF 等。针对这些 SCF 波函数的电子相关修正,GAMESS 提供了多种方法,如 组态相互作用(CI)二阶微扰理论(MP2)耦合簇方法(CC) ,以及 密度泛函理论(DFT) 近似。

激发态计算可通过 CI、EOMTD-DFT 方法实现。程序支持计算核梯度,从而实现自动几何优化、过渡态搜索与反应路径追踪 。此外,能量 Hessian 的计算可用于预测振动频率 ,并可获得红外(IR)与拉曼(Raman)光谱强度

在溶剂效应方面,GAMESS 提供了 有效片段势(EFP)模型极化连续介质模型(PCM) 等处理方式。程序还支持多种相对论效应计算 ,包括无限阶双组分标量相对论修正多种自旋--轨道耦合选项

片段分子轨道法(FMO) 使得这些高水平量子化学计算可应用于大型体系 ,通过将体系划分为若干小片段以实现高效并行计算。此外,GAMESS 还可进行核波函数计算 ,如 振动自洽场(VSCF) 方法或 NEO(Nuclear--Electronic Orbital) 方法,实现对核轨道的显式量子化处理。

GAMESS 能计算多种分子性质 ,从简单的偶极矩频率依赖的超极化率 。程序内部集成了大量基组库 ,并包含有效芯势(ECP)模型芯势(MCP),几乎涵盖整个元素周期表。

多数计算均可通过直接方法并行模式 运行,以充分利用现代计算硬件。为便于结果可视化,GAMESS 提供了 MacMolplt 图形程序(可在 macOS、Windows 或 Linux 平台运行),而 Avogadro 程序可协助生成输入文件并进行结构建模。

GAMESS 获取

https://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/

安装 GAMESS

bash 复制代码
tar vxfz gamess-current.tar.gz
cd gamess
./config
answer questions...
 
make ddi
make -j20

经过上述过程,我得到了 gamess.00.x 和 ddikick.x

修改 rungms

bash 复制代码
#Line 164
- if($# > 5) then 
+ if($#argv > 5) then
 
- set SCR=~/gamess/restart
+ set SCR=/home/usr/src/gamess/restart
 
- set USERSCR=~/gamess/restart
+ set USERSCR=/home/usr/src/gamess/restart
 
- set GMSPATH=~/gamess
+ set GMSPATH=/home/usr/src/gamess

参考资料

https://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/

https://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/download.html

https://molecularmodelingbasics.blogspot.com/search/label/gamess

https://www.webmo.net/support/gamess_linux.html

https://sites.google.com/site/rangsiman1993/comp-chem/program-install/install-gamess

相关推荐
方便面不加香菜4 小时前
Linux--基础IO(一)
linux·运维·服务器
love530love6 小时前
LiveTalking 数字人项目 Windows 部署完全指南(EPGF 架构)
人工智能·windows·python·架构·livetalking·epgf
遇事不決洛必達6 小时前
【Python基础】GIL 锁是什么及其对爬虫的影响
爬虫·python·线程·进程·gil锁
CryptoPP7 小时前
快速对接东京证券交易所API数据:实战指南与代码示例
开发语言·人工智能·windows·python·信息可视化·区块链
探物 AI7 小时前
把 MambaOut 塞进 YOLOv11:会有什么样的反应
python·yolo·计算机视觉
如竟没有火炬8 小时前
最大矩阵——单调栈
数据结构·python·线性代数·算法·leetcode·矩阵
阳区欠8 小时前
【LangChain】LLM基础介绍
开发语言·python·langchain
Cosolar8 小时前
保姆级 CrewAI 教程:从零构建多智能体协作系统
人工智能·python·架构
GDAL8 小时前
使用 uv 管理 Python 版本
python·uv·版本
真实的菜8 小时前
Redis 从入门到精通(十二):典型业务场景实战 —— 排行榜、限流器、秒杀系统、Session 共享
数据库·redis·python