基因组组装：3. juicer 比对 HiC 数据至参考基因组为了将组装完成的 contig 数据拼接成为 scaffold，需要测定样本的 HiC 数据，通过片段间的互作强度推断片段间的物理距离，互作强度越强，物理距离越近，据此将分散的 contig 挂载成为 scaffold。其中，一般使用 Juicer 软件将 HiC 数据比对至基因组并构建 contig 间互作强度矩阵。然后，根据 Juicer 软件的输出，使用 3D-DNA 软件将 contig 挂载成为 scaffold。本文主要介绍如何使用 Juicer 软件分析 HiC 数据，下一篇博文将介绍 3D