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Blockbuater_drug
19 天前
c语言
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开源
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溶剂可及表面积
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python api
FreeSASA: 开源 SASA 计算库,pip 一条命令替代 NACCESS
你算溶剂可及表面积(SASA)还在用要注册的闭源 NACCESS 吗?这篇给你 FreeSASA——MIT 协议开源 C 库,pip 一条命令装好,CLI + Python API 双接口,L&R 与 S&R 两种算法互差仅 0.1%,毫秒级出数。附三条安装路线、逐残基暴露排名 Python 示例(真实输出)、4 条实测踩坑、与 NACCESS/DSSP/PyMOL 等选型对比表,照抄代码 5 分钟接进你的脚本。
沐籽李
2 个月前
人工智能
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从溶剂可及表面积SASA理解抗体结构与工程改造
在抗体药物研发中,我们经常会提出一些看似简单、实际上并不容易回答的问题。一个框架区残基位于抗体表面,是否就意味着它可以安全地替换为人源胚系残基?一个CDR残基在复合物结构中靠近抗原,是否就一定对亲和力有重要贡献?在CDR中引入一个组氨酸,是否就能够使抗体获得酸性pH依赖的结合能力?两个AI模型预测的抗体结构整体RMSD很低,为什么计算得到的疏水斑块、界面面积和可开发性风险却可能明显不同?
我是有底线的