技术栈
蛋白构象
纪伊路上盛名在
8 天前
结构
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蛋白质
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动力学模拟
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蛋白构象
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动力学信息
金属蛋白的动力学模拟3
书接上文金属蛋白的动力学模拟2,我们在做好了预处理前的一切准备之后,之后就是正式做拓扑体系的准备了,并展开模拟了。
纪伊路上盛名在
1 个月前
深度学习
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生成式模型
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对接
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蛋白构象
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蛋白-配体
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局部
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se3
PLACER 局部预测蛋白 - 配体构象集合
参考:https://github.com/baker-laboratory/PLACER全称:Protein-Ligand Atomistic Conformational Ensemble Resolver,旧名ChemNet,Baker实验室开发的原子层面图神经网络(GNN,SE(3)等旋转等变架构,依赖e3nn),本质是随机去噪网络。
我是有底线的