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微生物生态学

道阻且长1994
1 年前
javascript·微生物生态学·数据探索分析
交互式探索微生物群落与生态功能的关系微生物群落在生态系统中发挥则重要功能,我们在对微生物群落进行分析时,会将不同分类水平(从门到属)的微生物类群的相对丰度与测定的某一生态功能进行相关性分析。但由于微生物类群数较多,又有不同的分类水平,将其包揽在一个图中,并显示不同的微生物类群的名字,会显得十分杂乱,因此我们尝试使用交互式的可视化来进行探索性分析。下面我们将结合R语言和javascript,来实现这一任务。考虑到微生物生态学方面的同学对JavaScript可能比较陌生,我们也提供了网络工具,为网友在线探索分析微生物各类群与生态功能的关系提供便
道阻且长1994
1 年前
学习·r语言·微生物生态学
微生物群落关键种识别:一种不依赖于网络的自上而下的方法微生物群落在促进养分循环、协助植物生长、维持人体健康等方面发挥着重要的作用。群落关键种对维持微生物群落稳定性具有重要影响,识别关键种一直是微生物生态学中的热点话题。识别关键种主要有两种框架:数据驱动的方法(data driven method)和去除实验(perturbation experiment)。其中数据驱动的方法主要有三种: