技术栈
医药
Biomamba生信基地
10 天前
ggplot2
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生信
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医药
ggplot2标度与标签
刻度与标签在 ggplot2 中,控制刻度与标签的核心思路是使用标度(Scale)函数。这些函数通常以 scale_开头,后接对应的美学属性(如 x_continuous, y_discrete, color, fill等),最后是修改的类型(如 breaks, labels, limits)。
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1 个月前
linux
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运维
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服务器
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生信
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医药
Linux| 二.计算机软件组成与Linux
写在前面上一节课我们算是详细的给大家介绍了计算机硬件的各部分组成以及他们基础的运行方式(跟着Biomamba一起学Linux| 一.计算机硬件组成),但如果一台电脑仅有硬件,那么它只是一副躯壳而已,它是没有灵魂的,只有装上了软件后,这一堆铁疙瘩才能成为真正能够为人类计算需求服务的设备。因此,这一次视频主要介绍计算机的软件组成以及Linux的历史、特点、优势及学习Linux的动机。从下一讲开始我们也将正式开始实操课程。
KG_LLM图谱增强大模型
1 个月前
大模型
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知识图谱
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graphrag
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医药
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知识图谱增强大模型
整合知识图谱与大语言模型:下一代药物发现的革命性技术
Integrating Knowledge Graphs and Large Language Models for Next-Generation Drug Discovery
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2 个月前
开发语言
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信息可视化
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r语言
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生信
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医药
R语言绘图神器| ggplot2与其基本用法介绍
ggplot2ggplot2是R语言中的可视化神包,由Hadley Wickham开发。其本质是一套基于“图层化、模块化”的绘图语法体系。它彻底改变了传统R 绘图(如grid)的 “命令式” 逻辑,通过将数据、图形元素、美学映射拆解为独立组件,让用户能像“搭积木”一样灵活构建复杂可视化,同时保证代码的可读性和可复现性。目前,ggplot2已成为数据科学、学术研究、商业分析中最主流的绘图工具之一,尤其擅长生成发表级别的高质量图表。我们给大家演示过的CellChat、Seurat、monocle等包的可视化内
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2 个月前
开发语言
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数据分析
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r语言
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医药
挑战用R语言硬干一百万单细胞数据分析
经常有同学咨询入手足够完成硕博生涯的生信环境能否完成一百万个单细胞的数据分析,其实这个问题比较难回答,大家的数据质量、分析环境、需要做的分析、算法都不尽相同。很难准确的评估。不过大概的量级还是可以测评的,我们往期也测试过1~30w细胞级别单细胞数据的硬件占用情况: 30w单细胞数据会吃掉多少内存? 5w单细胞在Monocle2拟时序中占据多少内存? CellChat细胞通讯运行内存及时间压力测试
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6 个月前
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r语言
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生信
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R语言基础| 下载、安装
在此前的单细胞教程中,许多小伙伴都曾因为R语言基础不足而十分苦恼。R语言是一种开源的编程语言和软件环境,专门用于统计分析、图形表示和数据挖掘。它最初由Ross Ihaka和Robert Gentleman在1993年创建,旨在为统计学家和数据分析师提供一个广泛的统计(线性和非线性建模、经典统计测试、时间序列分析、分类、聚类等)和图形技术的集成环境。R语言以其强大的数据处理能力、图形系统以及在统计计算和图形显示方面的灵活性而闻名。此外,R语言具有一个庞大的用户社区,提供了大量的包(libraries)和工具
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6 个月前
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r语言
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生信
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R语言基础| 创建数据集
在R语言中,有多种数据类型,用以存储和处理数据。每种数据类型都有其特定的用途和操作函数,使得R语言在处理各种数据分析任务时非常灵活和强大:
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6 个月前
r语言
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可视化
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R语言基础| 可视化初探(ggplot2)
写在前面ggplot2 是一个基于 R 语言的数据可视化包,提供了一种结构化的方法来描述和构建图表,因此被广泛用于制作可视化图表。其是tidyverse数据科学生态系统的一部分。
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1 年前
开发语言
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python
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r语言
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医药
R语言基础| 功效分析
写在前面R语言在进行统计分析和数据处理方面具有多种优势,在R语言中进行功效分析(power analysis)同样很方便,R环境中有pwr、powerAnalysis、simr等包可支持功效分析,结合其可视化能力及与其它方法整合的灵活性,为R语言中的功效分析提供了良好的生态。
我是有底线的