🍅 课程：生物信息学_玉泉路_课堂笔记 中科院_2022秋季课 第一学期
🍅 个人笔记使用
🍅 2023/7/20
上周回顾
从头基因组组装与注释
第一节 基因组调查
最左边的 error-peak 是测序错误导致的
杂合导致的峰
重复序列 在纯和峰值的右边（整数倍的地方出现）
整理以上信息可以使用的软件
第二节 从头基因组组装
从头组装 VS 比较组装
从头组装 就像自己拼图 没有参考
打断 得到reads
通过测序reads 得到
contigs 连续的序列 中间没gap
scaffolds有 gap
就是有一些杂合
如何做基因组的组装？
图论的方法去解决
转换成一个图
OLC方法
DBG方法
评估基因组组装的好坏
N50
L50
完整性
第三节 基因组注释和基因预测
了解程度
