conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
三川6987 小时前
Tkinter库的学习记录08- 容器控件
python
c_lb72887 小时前
近期AI量化工具选择,学习开发执行要分开
人工智能·python
天天进步20157 小时前
Python全栈项目--校园食堂点餐与推荐系统
开发语言·python
Ulyanov7 小时前
雷达导引头体制演进、技术特点与数学模型
python·雷达电子对抗·导引头
eybk7 小时前
写一个可以编制pdf文件的python程序
开发语言·python·pdf
卷无止境7 小时前
从Python的cryptography库出发,从零开始理解密码学,到构建零信任网络
后端·python
YFJ_mily7 小时前
**Python 实战:写一个论文 PDF 投稿自检工具|附 IPAT 2026 智能光子学会议征稿信息
人工智能·python·pdf·量子计算·论文投稿·智能光子学
三川6987 小时前
Tkinter库的学习记录05-文本框Entry
python
cui_ruicheng7 小时前
Python从入门到实战(八):封装、多态与抽象类
开发语言·python
nanawinona8 小时前
2026年AI量化工具怎么选,先定位学习开发还是执行
人工智能·python