conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
markfeng812 分钟前
Python+Django+H5+MySQL项目搭建
python·django
GinoWi1 小时前
Chapter 2 - Python中的变量和简单的数据类型
python
JordanHaidee1 小时前
Python 中 `if x:` 到底在判断什么?
后端·python
ServBay1 小时前
10分钟彻底终结冗长代码,Python f-string 让你重获编程自由
后端·python
闲云一鹤2 小时前
Python 入门(二)- 使用 FastAPI 快速生成后端 API 接口
python·fastapi
Rockbean3 小时前
用40行代码搭建自己的无服务器OCR
服务器·python·deepseek
曲幽3 小时前
FastAPI + Ollama 实战:搭一个能查天气的AI助手
python·ai·lora·torch·fastapi·web·model·ollama·weatherapi
用户60648767188964 小时前
国内开发者如何接入 Claude API?中转站方案实战指南(Python/Node.js 完整示例)
人工智能·python·api
只与明月听5 小时前
RAG深入学习之Chunk
前端·人工智能·python
用户8356290780516 小时前
自动化文档处理:Python 批量提取 PDF 图片
后端·python