conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
龙山云仓1 分钟前
No152:AI中国故事-对话祖冲之——圆周率与AI精度:数学直觉与极限探索
大数据·开发语言·人工智能·python·机器学习
琅琊榜首20206 分钟前
AI+Python实操指南:用编程赋能高质量网络小说创作
开发语言·人工智能·python
Faker66363aaa6 分钟前
基于YOLO13-C3k2-Strip的神经退行性疾病MRI影像自动识别
python
Dxy123931021631 分钟前
Python 将 JSON 字符串转换为字典
前端·python·json
堕27434 分钟前
java数据结构当中的《Lambda表达式》
java·数据结构·python
小鸡吃米…1 小时前
TensorFlow - TensorBoard 可视化
python·tensorflow·neo4j
OPEN-Source1 小时前
给 Agent 安装技能:工具抽象、自动选工具与安全边界
人工智能·python·agent·rag·deepseek
ljxp12345682 小时前
高效删除链表重复节点
python
52Hz1182 小时前
力扣207.课程表、208.实现Trie(前缀树)
python·leetcode
骇城迷影2 小时前
从零复现GPT-2 124M
人工智能·pytorch·python·gpt·深度学习