conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
2601_962099465 小时前
Python xlwt设置excel单元格字体及格式
python·excel·xlwt·样式设置·单元格格式
奇牙coding1235 小时前
GPT-6-Astra API 接入教程:OpenRouter 路由配置 + Python/curl 示例 + 静默降级踩坑
开发语言·python·gpt·ai
2601_962298275 小时前
Python与Selenium结合的Web自动化测试全流程实践教程
自动化测试·python·selenium·web测试·pageobjectmodel
天衍四九-6 小时前
第一章:从 LLM 到 Agent —— DeepSeek Harness 入门
网络·数据库·人工智能·python
529宝宝起名网6 小时前
用 Python 实现名字寓意评分算法:基于 NLP 语义分析的名字内涵深度评估
python·算法·自然语言处理
2601_962298676 小时前
Python:对象缓存优化机制(CPython)
python·性能优化·内存优化·cpython·对象缓存
枫彩7 小时前
A股数据源怎么选?用 Python 验收 AI 复盘的日期与明细
python·ai agent·股票数据·mcp
2601_962382437 小时前
Python 代码不可不知的函数式编程技术
python·函数式编程·高阶函数·嵌套函数·头等函数
2601_962078037 小时前
Python办公自动化与数据分析实战 培训班2021年
python·数据分析·办公自动化·自动化办公·实战演练
用户938515635077 小时前
Text2SQL 实战:用 DeepSeek 大模型实现自然语言查询 SQLite 数据库
python·sqlite