conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
测试199811 分钟前
软件测试之压力测试
自动化测试·软件测试·python·测试工具·职场和发展·测试用例·压力测试
Swizard14 分钟前
极限瘦身:将 Python AI 应用从 100MB 砍到 30MB
java·python·ai·移动开发
编织幻境的妖21 分钟前
Python代码性能优化工具与方法
开发语言·python·性能优化
Rookie_JE38 分钟前
python docxtpl库学习
python
我不是小upper39 分钟前
CNN+BiLSTM !!最强序列建模组合!!!
人工智能·python·深度学习·神经网络·cnn
锐学AI1 小时前
从零开始学MCP(四)- 认识MCP clients
人工智能·python
爱打代码的小林1 小时前
python基础(pandas库)
服务器·python·pandas
shenzhenNBA1 小时前
如何在python文件中使用日志功能?简单版本
java·前端·python·日志·log
编织幻境的妖1 小时前
Python垃圾回收机制详解
开发语言·python