conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
yaoh.wang6 小时前
力扣(LeetCode) 13: 罗马数字转整数 - 解法思路
python·程序人生·算法·leetcode·面试·职场和发展·跳槽
小鸡吃米…7 小时前
Python PyQt6教程七-控件
数据库·python
1916zz8 小时前
Extreme programing 方利喆 _ 江贤晟
python
长安牧笛8 小时前
智能鞋柜—脚气终结者,内置温湿度传感器和紫外线灯,晚上回家,把鞋放进去,自动检测湿度,湿度超标就启动烘干+紫外线杀菌,第二天穿鞋干燥无异味。
python
weixin_457760008 小时前
PIL库将图片位深度是1、8、32统一转换为24的方法
python
Lucky高9 小时前
Pandas库入门
python·pandas
小鸡吃米…10 小时前
Python PyQt6教程三-菜单与工具栏
开发语言·python
Jack电子实验室10 小时前
【杭电HDU】校园网(DeepL/Srun)自动登录教程
python·嵌入式硬件·计算机网络·自动化
木头左10 小时前
二值化近似计算在量化交易策略中降低遗忘门运算复杂度
python
Jelena1577958579210 小时前
Java爬虫淘宝拍立淘item_search_img拍接口示例代码
开发语言·python