conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
雪域迷影13 分钟前
使用Python库获取网页时报HTTP 403错误(禁止访问)的解决办法
开发语言·python·http·beautifulsoup·urllib
吃茄子的猫20 分钟前
python中global全局变量
python
Flash.kkl21 分钟前
Python基础语法
开发语言·python
veminhe28 分钟前
Python(二) 容器类型与对应操作行为
python
人工干智能37 分钟前
调用client.beta.threads.runs.create后交由OpenAI云服务器端的处理
服务器·python·llm
wyg_03111344 分钟前
机器问道:大模型RAG 解读凡人修仙传
人工智能·python·transformer
未来之窗软件服务44 分钟前
幽冥大陆(七十九)Python 水果识别训练视频识别 —东方仙盟练气期
开发语言·人工智能·python·水果识别·仙盟创梦ide·东方仙盟
weixin_462446231 小时前
用 python -m ensurepip --upgrade 修复 uv / venv 中缺失 pip 的问题
python·pip·uv
民乐团扒谱机1 小时前
【微实验】Python——量子增强时频传递的精度量化
人工智能·python·aigc·量子力学·时空·参数敏感性·光量子
Feibo20111 小时前
管理agent
python