conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
benchmark_cc1 小时前
REST API 和 Python SDK 应该怎么选?量化交易数据接口选型实战
开发语言·python·数据分析·pandas·量化交易·股票数据·quantdash
2601_962382432 小时前
python快乐编程网络爬虫课后答案
python·网络爬虫·学习工具·课后答案·刷题app
鹏哥带你干乡墅3 小时前
优选乡墅赋能培训平台如何帮助提升乡村建设?
大数据·人工智能·python
veminhe3 小时前
python调用接口获取网络信息
python
Allen_LVyingbo4 小时前
医疗AI基础2026-构建可靠智能体的编程路径(上)
大数据·数据库·人工智能·python·自动化
Rnan-prince5 小时前
堆与TopK · 从零到通透 —— 9 节全系列复盘
python·算法
2601_962294616 小时前
Python接口自动化测试实战:使用requests库
python·接口自动化测试·异常处理·requests库·api测试
砚底藏山河6 小时前
【量化纯GET实战 #23】多股票相关性:用收益率看板块联动
java·数据库·python·金融·数据分析
阿童木写作6 小时前
跨境电商翻译工具推荐:批量图片翻译+视频字幕实时翻译
人工智能·python·音视频
晶捷软件6 小时前
晶捷智能:集团型制造企业ERP如何实现多工厂统一管控
大数据·人工智能·python·制造