conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
2301_812539676 分钟前
CSS如何引入CSS形状生成器_通过自定义属性实现图形化样式
jvm·数据库·python
m0_6091604943 分钟前
Golang怎么实现数据库连接重试_Golang如何在启动时重试连接直到数据库就绪【技巧】
jvm·数据库·python
花米徐1 小时前
技术洞察精选 | 2026年4月28日 — 5月4日
后端·python·flask
宝贝儿好2 小时前
【LLM】第三章:项目实操案例:智能输入法项目
人工智能·python·深度学习·算法·机器人
m0_624578592 小时前
如何在phpMyAdmin中导入GZIP压缩格式文件_加速传输并突破文件大小限制
jvm·数据库·python
m0_495496412 小时前
mysql数据库表名区分大小写吗_通过lower case table names配置
jvm·数据库·python
weixin_459753942 小时前
MySQL主从同步跳过错误影响一致性_使用pt-table-sync修复
jvm·数据库·python
kexnjdcncnxjs2 小时前
如何解决Oracle 12c以上版本的ORA-65096_C##公共用户前缀限制
jvm·数据库·python
zhoutongsheng3 小时前
MySQL触发器无法触发的原因分析_MySQL触发器排查指南
jvm·数据库·python