conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
007php0076 小时前
某游戏大厂 Java 面试题深度解析(四)
java·开发语言·python·面试·职场和发展·golang·php
景彡先生6 小时前
Python pandas数据透视表(pivot_table)详解:从入门到实战,多维数据分析利器
python·数据分析·pandas
Blossom.1187 小时前
把AI“编”进草垫:1KB决策树让宠物垫自己报「如厕记录」
java·人工智能·python·算法·决策树·机器学习·宠物
极客数模8 小时前
2025年(第六届)“大湾区杯”粤港澳金融数学建模竞赛准备!严格遵循要求,拿下大奖!
大数据·python·数学建模·金融·分类·图论·boosting
倔强青铜三8 小时前
苦练Python第73天:玩转对象持久化,pickle模块极速入门
人工智能·python·面试
程序员三藏8 小时前
Postman持久化保存/设置断言详解
自动化测试·软件测试·python·测试工具·职场和发展·接口测试·postman
jiayi_19998 小时前
Linux 容器安装 conda 和 pip
linux·conda·pip
java1234_小锋8 小时前
PyTorch2 Python深度学习 - 卷积神经网络(CNN)介绍实例 - 使用MNIST识别手写数字示例
python·深度学习·cnn·pytorch2
雍凉明月夜8 小时前
人工智能学习中深度学习之python基础之迭代器、生成器、文件处理和模块等
python·深度学习·学习·pycharm