conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
小熊Coding2 分钟前
童年游戏冒险岛(Python版本)
python·游戏·pygame
WJ.Polar20 分钟前
Scapy基本应用
linux·运维·网络·python
H_unique39 分钟前
LangChain:调用工具Ⅲ
python·langchain
醉舞经阁半卷书11 小时前
深入掌握LangChain
python·langchain
CDN3601 小时前
[硬核] 你的DNS正在“裸奔”?用Python手撕DNS劫持与隧道检测逻辑
开发语言·网络·python
kybs19912 小时前
springboot视频推荐系统--附源码72953
java·spring boot·python·eclipse·asp.net·php·idea
BU摆烂会噶3 小时前
【LangGraph】运行时上下文(Runtime Context)
人工智能·python·langchain
xingbuxing_py3 小时前
精华贴分享|北交所:小市值策略的“甜蜜陷阱”还是“弹性引擎”?——一份轻度理解
python·金融·股票·理财·量化投资·股市·炒股
yj15583 小时前
在装修预算有限的情况下,哪些地方可以省?
python
TickDB3 小时前
Python 接入国内期货 Tick 行情:从 CTP 到统一 API 的工程实践
python·websocket