conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
智算菩萨28 分钟前
【OpenGL】10 完整游戏开发实战:基于OpenGL的2D/3D游戏框架、物理引擎集成与AI辅助编程指南
人工智能·python·游戏·3d·矩阵·pygame·opengl
jason成都1 小时前
IoT 设备监控系统实战:基于 EMQX 的 MQTT 连接监控与数据格式指纹识别
开发语言·python
愤豆2 小时前
05-Java语言核心-语法特性--模块化系统详解
java·开发语言·python
AI-Ming2 小时前
程序员转行学习 AI 大模型: 踩坑记录:服务器内存不够,程序被killed
服务器·人工智能·python·gpt·深度学习·学习·agi
2401_873544922 小时前
使用Python处理计算机图形学(PIL/Pillow)
jvm·数据库·python
njidf2 小时前
自动化机器学习(AutoML)库TPOT使用指南
jvm·数据库·python
只与明月听3 小时前
RAG深入学习之向量数据库
前端·人工智能·python
极光代码工作室3 小时前
基于Hadoop的日志数据分析系统设计
大数据·hadoop·python·数据分析·数据可视化
AAI机器之心3 小时前
这个RAG框架绝了:无论多少跳,LLM只调用两次,成本暴降
人工智能·python·ai·llm·agent·产品经理·rag
Fairy要carry3 小时前
项目01-手搓Agent之loop
前端·javascript·python