conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
数据智能老司机5 小时前
精通 Python 设计模式——分布式系统模式
python·设计模式·架构
数据智能老司机6 小时前
精通 Python 设计模式——并发与异步模式
python·设计模式·编程语言
数据智能老司机6 小时前
精通 Python 设计模式——测试模式
python·设计模式·架构
数据智能老司机6 小时前
精通 Python 设计模式——性能模式
python·设计模式·架构
c8i7 小时前
drf初步梳理
python·django
每日AI新事件7 小时前
python的异步函数
python
这里有鱼汤8 小时前
miniQMT下载历史行情数据太慢怎么办?一招提速10倍!
前端·python
databook17 小时前
Manim实现脉冲闪烁特效
后端·python·动效
程序设计实验室17 小时前
2025年了,在 Django 之外,Python Web 框架还能怎么选?
python
倔强青铜三19 小时前
苦练Python第46天:文件写入与上下文管理器
人工智能·python·面试