conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
费弗里2 小时前
Python全栈应用开发利器Dash 3.x新版本介绍(1)
python·dash
李少兄9 天前
解决OSS存储桶未创建导致的XML错误
xml·开发语言·python
就叫飞六吧9 天前
基于keepalived、vip实现高可用nginx (centos)
python·nginx·centos
Vertira9 天前
PyTorch中的permute, transpose, view, reshape和flatten函数详解(已解决)
人工智能·pytorch·python
学Linux的语莫9 天前
python基础语法
开发语言·python
匿名的魔术师9 天前
实验问题记录:PyTorch Tensor 也会出现 a = b 赋值后,修改 a 会影响 b 的情况
人工智能·pytorch·python
Ven%9 天前
PyTorch 张量(Tensors)全面指南:从基础到实战
人工智能·pytorch·python
mahuifa9 天前
PySide环境配置及工具使用
python·qt·环境配置·开发经验·pyside
大熊猫侯佩9 天前
ruby、Python 以及 Swift 语言关于 “Finally” 实现的趣谈
python·ruby·swift
19899 天前
【Dify精讲】第19章:开源贡献指南
运维·人工智能·python·架构·flask·开源·devops