conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
用户8356290780515 小时前
Python 实现 PDF 文件加密与解密方法
后端·python
用户8356290780515 小时前
使用 Python 冻结与拆分 Excel 窗格教程
后端·python
你好潘先生13 小时前
别再记命令了,用 yeero do 说句人话就能跑脚本,而且不烧 token
服务器·python·命令行
Agent_大师14 小时前
WebSocket 行情重连成功,K线缺口不会自动消失
python
荣码14 小时前
LLM结构化输出:让AI返回JSON而不是废话,我踩了4个坑
java·python
copyer_xyf14 小时前
FastAPI 如何连接 MySQL
后端·python
apocelipes1 天前
常用编程语言和库的正则表达式性能对比
c语言·c++·python·性能优化·golang·开发工具和环境
用户8356290780511 天前
使用 Python 在 PDF 中创建与管理书签
后端·python
MeixianAgent1 天前
Python 回测数据入口怎么验?历史 K 线入库前先做 5 个检查
后端·python
咕白m6252 天前
用 Python 实现一键批量查找与替换 Excel 数据
后端·python