conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
MediaTea30 分钟前
Python 第三方库:cv2(OpenCV 图像处理与计算机视觉库)
开发语言·图像处理·python·opencv·计算机视觉
江塘1 小时前
机器学习-决策树多种生成方法讲解及实战代码讲解(C++/Python实现)
c++·python·决策树·机器学习
多彩电脑1 小时前
死循环逻辑检测
数据结构·python·算法·动态规划
YongCheng_Liang1 小时前
Python 基础核心模块全解析:从入门到实践的知识框架
python
RanMatrix1 小时前
python-logging模块
python
e***74951 小时前
Redis——使用 python 操作 redis 之从 hmse 迁移到 hset
数据库·redis·python
Ace_31750887762 小时前
京东商品详情接口终极突破:从多接口联动解析到数据全息重构
python·重构
汗流浃背了吧,老弟!2 小时前
Langchian检索YouTube视频字幕
python·音视频
励志前端小黑哥2 小时前
uv包管理器--python也有自己的pnpm了
开发语言·python·uv
2501_941112072 小时前
深入理解Python的if __name__ == ‘__main__‘
jvm·数据库·python