conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
Desire.9841 分钟前
Python 数学建模——灰色关联度分析
python·数学建模·灰色关联度
小鹿( ﹡ˆoˆ﹡ )18 分钟前
Python中的树与图:构建复杂数据结构的艺术
开发语言·python
阡之尘埃24 分钟前
Python数据分析案例59——基于图神经网络的反欺诈交易检测(GCN,GAT,GIN)
python·神经网络·数据挖掘·数据分析·图神经网络·反欺诈·风控大数据
xiaojiesec28 分钟前
第157天: 安全开发-Python 自动化挖掘项目&SRC 目标&FOFA 资产&Web 爬虫解析库
python·安全
27划流星雨_32 分钟前
from tqdm.auto import tqdm用法详细介绍
python
爱里承欢。37 分钟前
【Python语言初识(二)】
python
hzw051044 分钟前
Jupyter的使用
ide·python·jupyter
憨憨小白2 小时前
函数的高级应用
开发语言·python·青少年编程·少儿编程
CV-King2 小时前
计算机视觉硬件知识点整理(三):镜头
图像处理·人工智能·python·opencv·计算机视觉
惟长堤一痕2 小时前
医学数据分析实训 项目三 关联规则分析作业--在线购物车分析--痹症方剂用药规律分析
python·数据分析