conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
用户2345267009821 分钟前
Python实现异步任务队列深度好文
后端·python
夫唯不争,故无尤也3 分钟前
PyTorch 的维度变形一站式入门
人工智能·pytorch·python
熊猫钓鱼>_>30 分钟前
从零开始构建RPG游戏战斗系统:实战心得与技术要点
开发语言·人工智能·经验分享·python·游戏·ai·qoder
BoBoZz191 小时前
TriangleStrip连续三角带
python·vtk·图形渲染·图形处理
生信大表哥1 小时前
Python单细胞分析-基于leiden算法的降维聚类
linux·python·算法·生信·数信院生信服务器·生信云服务器
一晌小贪欢1 小时前
【Python办公】用 Selenium 自动化网页批量录入
开发语言·python·selenium·自动化·python3·python学习·网页自动化
诸神缄默不语2 小时前
如何用Python处理文件:Word导出PDF & 如何用Python从Word中提取数据:以处理简历为例
python·pdf·word
vvoennvv2 小时前
【Python TensorFlow】 TCN-LSTM时间序列卷积长短期记忆神经网络时序预测算法(附代码)
python·神经网络·机器学习·tensorflow·lstm·tcn
nix.gnehc2 小时前
PyTorch
人工智能·pytorch·python
z***3353 小时前
SQL Server2022版+SSMS安装教程(保姆级)
后端·python·flask