conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
天才少女爱迪生20 小时前
LLVM(Low Level Virtual Machine)介绍
python·数据挖掘
碳酸的唐1 天前
A* 工程实践全指南:从启发式设计到可视化与性能优化
python·神经网络
倔强青铜三1 天前
苦练Python第64天:从零掌握多线程,threading模块全面指南
人工智能·python·面试
Q26433650231 天前
【有源码】基于Hadoop生态的大数据共享单车数据分析与可视化平台-基于Python与大数据的共享单车多维度数据分析可视化系统
大数据·hadoop·python·机器学习·数据分析·spark·毕业设计
计算机毕业设计木哥1 天前
计算机毕设选题推荐:基于Hadoop和Python的游戏销售大数据可视化分析系统
大数据·开发语言·hadoop·python·信息可视化·spark·课程设计
小蕾Java1 天前
PyCharm 2025:使用图文教程!
ide·python·pycharm
踏过山河,踏过海1 天前
【After Anaconda installation,conda can not run】
conda
至此流年莫相忘1 天前
配置Python环境之Conda
python·conda
cooldream20091 天前
深入解析 Conda、Anaconda 与 Miniconda:Python 环境管理的完整指南
开发语言·python·conda