conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
hhh3u3u3u6 分钟前
Visual C++ 6.0中文版安装包下载教程及win11安装教程
java·c语言·开发语言·c++·python·c#·vc-1
好家伙VCC42 分钟前
**发散创新:基于Python与ROS的机器人运动控制实战解析**在现代机器人系统开发中,**运动控制**是实现智能行为的核心
java·开发语言·python·机器人
2401_8274999942 分钟前
python项目实战09-AI智能伴侣(ai_partner_2-3)
开发语言·python
派葛穆1 小时前
汇川PLC-Python与汇川easy521plc进行Modbustcp通讯
开发语言·python
代码小书生1 小时前
Matplotlib,Python 数据可视化核心库!
python·信息可视化·matplotlib
默 语2 小时前
Records、Sealed Classes这些新特性:Java真的变简单了吗?
java·开发语言·python
架构师老Y2 小时前
013、数据库性能优化:索引、查询与连接池
数据库·python·oracle·性能优化·架构
Kel2 小时前
PydanticAI 源码深潜:类型安全依赖注入与图执行引擎的双核架构解析
人工智能·python·架构
卷心菜狗2 小时前
Python进阶-深浅拷贝辨析
开发语言·python
Thomas.Sir2 小时前
重构诊疗效率与精准度之【AI 赋能临床诊断与辅助决策从理论到实战】
人工智能·python·ai·医疗·诊断