conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
唐装鼠1 小时前
Nginx + Gunicorn + Python Web 应用 架构(Claude)
python·nginx·gunicorn
梦想三三1 小时前
【PYthon词频统计与文本向量化】苏宁易购评论分析实战
开发语言·python
biter down2 小时前
9:JSONSchema
python
日晨难再2 小时前
C语言&Python&Bash&Tcl:全局变量和局部变量
c语言·python·bash·tcl
麻雀飞吧2 小时前
期货量化主连和具体合约怎么切:天勤 KQ.m 与 KQ.i 用法
python·区块链
先吃饱再说2 小时前
Python List 切片与 LLM Prompt 设计:从数据结构到接口调用
python
一只专注api接口开发的技术猿2 小时前
OpenClaw 对接淘宝商品 API,低成本实现全天候选品监控|附可运行 Python 实操代码
大数据·开发语言·数据库·python
xingpanvip2 小时前
星盘接口开发文档:马盘次限盘接口指南
android·开发语言·python·php·lua
FBI HackerHarry浩2 小时前
第二阶段Day07【Python生成器、yield关键字、property、正则表达式】
开发语言·python·正则表达式
梦想不只是梦与想2 小时前
Python 中的 4 种作用域
python·作用域