conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
大霞上仙25 分钟前
nonlocal 与global关键字
开发语言·python
Mark_Aussie1 小时前
Flask-SQLAlchemy使用小结
python·flask
程序员阿龙1 小时前
【精选】计算机毕业设计Python Flask海口天气数据分析可视化系统 气象数据采集处理 天气趋势图表展示 数据可视化平台源码+论文+PPT+讲解
python·flask·课程设计·数据可视化系统·天气数据分析·海口气象数据·pandas 数据处理
ZHOU_WUYI1 小时前
Flask与Celery 项目应用(shared_task使用)
后端·python·flask
弱冠少年1 小时前
conda入门
conda
John Song1 小时前
conda指定包安装的channel
conda
且慢.5891 小时前
Python_day47
python·深度学习·计算机视觉
佩奇的技术笔记2 小时前
Python入门手册:异常处理
python
Gene_20222 小时前
conda环境配置(一) —— 常用虚拟环境操作命令
conda
大写-凌祁2 小时前
论文阅读:HySCDG生成式数据处理流程
论文阅读·人工智能·笔记·python·机器学习