conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
WJX_KOI16 分钟前
Open Notebook 一个开源的结合AI的记笔记软件
python
0思必得01 小时前
[Web自动化] 反爬虫
前端·爬虫·python·selenium·自动化
2301_822382761 小时前
Python上下文管理器(with语句)的原理与实践
jvm·数据库·python
喵手2 小时前
Python爬虫实战:从零搭建字体库爬虫 - requests+lxml 实战采集字体网字体信息数据(附 CSV 导出)!
爬虫·python·爬虫实战·零基础python爬虫教学·csv导出·采集字体库数据·字体库字体信息采集
2301_790300962 小时前
Python深度学习入门:TensorFlow 2.0/Keras实战
jvm·数据库·python
程序员敲代码吗4 小时前
用Python生成艺术:分形与算法绘图
jvm·数据库·python
Yyyyy123jsjs4 小时前
如何通过免费的外汇API轻松获取实时汇率数据
开发语言·python
喵手4 小时前
Python爬虫实战:GovDataMiner —— 开放数据门户数据集元数据采集器(附 CSV 导出)!
爬虫·python·爬虫实战·python爬虫工程化实战·零基础python爬虫教学·open data·开放数据门户数据集列表
历程里程碑4 小时前
滑动窗口---- 无重复字符的最长子串
java·数据结构·c++·python·算法·leetcode·django