conda常用命令

刚刚尝试用conda管理自己用的一些生信软件,这里记录常用的一些命令

linux系统上下载并安装conda:

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

后续具体步骤参照 -------生信技能树conda管理生信软件一文就够

查看是否成功安装

source ~/.bashrc

未出现任何提示,说明安装成功,进行下一步调用conda命令

conda --help

若出现"conda command not found"这样的语句,则可以通过编辑~/.bashrc文件

vim ~/.bashrc

在~/.bashrc文件结尾加上

export PATH=~/具体conda安装路径/bin:$PATH

退出后,再次执行

source ~/.bashrc

conda --help

配置conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes
source ~/.condarc

通过source ~/.condarc查看现有环境配置镜像,vim命令可以编辑 ~/.condarc删除失败的镜像。

创建小环境

conda create -n +创建环境名称

查看小环境

conda info -e

进入小环境

source activate +环境名称

查看小环境已安装的软件

conda list

安装相应版本的软件

conda install PACKAGENAME==VERSION

查找相应的软件包

conda search PACKAGENAME

退出小环境

conda deactivate

移除小环境

conda env remove --name bio-env

作者:阿糖胞苷_SYSU

链接:https://www.jianshu.com/p/acab8ea232b1

来源:简书

著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

conda常用命令 - 简书

相关推荐
敲键盘的小夜猫22 分钟前
Python核心数据类型全解析:字符串、列表、元组、字典与集合
开发语言·python
apcipot_rain1 小时前
【应用密码学】实验五 公钥密码2——ECC
前端·数据库·python
小彭律师1 小时前
门禁人脸识别系统详细技术文档
笔记·python
鸿业远图科技2 小时前
分式注记种表达方式arcgis
python·arcgis
别让别人觉得你做不到3 小时前
Python(1) 做一个随机数的游戏
python
小彭律师5 小时前
人脸识别门禁系统技术文档
python
张小九996 小时前
PyTorch的dataloader制作自定义数据集
人工智能·pytorch·python
zstar-_6 小时前
FreeTex v0.2.0:功能升级/支持Mac
人工智能·python·macos·llm
苏生要努力7 小时前
第九届御网杯网络安全大赛初赛WP
linux·python·网络安全
于壮士hoho7 小时前
DeepSeek | AI需求分析
人工智能·python·ai·需求分析·dash