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†《LAMMPS小技巧》： ‾ \textbf{ \underline{\dag《LAMMPS小技巧》：}} †《LAMMPS小技巧》： 主要介绍采用分子动力学（ L a m m p s Lammps Lammps）模拟相关安装教程、原理以及模拟小技巧（难度： ★ \bigstar ★）
††《LAMMPS实例教程---In文件详解》： ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag《LAMMPS实例教程---In文件详解》：}} ††《LAMMPS实例教程---In文件详解》： 主要介绍采用分子动力学（ L a m m p s Lammps Lammps）模拟相关物理过程模拟。（包含：热导率计算、定压比热容计算，难度： ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★）
†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》： ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》：}} †††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》： 主要介绍针对分子模拟的动力学过程（轨迹文件）进行后相关的处理分析（需要一定编程能力。难度： ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★）。
††††《分子动力学后处理集成函数---Matlab》： ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag《分子动力学后处理集成函数---Matlab》：}} ††††《分子动力学后处理集成函数---Matlab》： 主要介绍针对后处理过程中指定函数，进行包装，方便使用者直接调用（需要一定编程能力，难度： ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★）。
†††††《SCI论文绘图---Python绘图常用模板及技巧》： ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag《SCI论文绘图---Python绘图常用模板及技巧》：}} †††††《SCI论文绘图---Python绘图常用模板及技巧》： 主要介绍针对处理后的数据可视化，并提供对应的绘图模板（需要一定编程能力，难度： ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★）。
††††††《分子模拟---Ovito渲染案例教程》： ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag\dag《分子模拟---Ovito渲染案例教程》：}} ††††††《分子模拟---Ovito渲染案例教程》： 主要采用 O v i t o \rm Ovito Ovito软件，对 L a m m p s \rm Lammps Lammps 生成的轨迹文件进行渲染（难度： ★ \bigstar ★ ★ \bigstar ★）。
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找到了大佬的评论：
嗯，那也就是盒子太大，尤其是 s b o u n d a r y \rm s\ boundary s boundary 的b边界条件。原子由于边界的改变，跑到了盒子之外。