R语言【paleobioDB】——pbdb_taxa():获得多个类群名的基本信息

Package paleobioDB version 0.7.0

paleobioDB 包在2020年已经停止更新,该包依赖PBDB v1 API。

可以选择在Index of /src/contrib/Archive/paleobioDB (r-project.org)下载安装包后,执行本地安装。


Usage

R 复制代码
pbdb_taxa (...)

Arguments

参数【...】:可通过 API 调用的参数。所有可用参数详见 PBDB Data Service: Lists of taxa


Value

返回一组类群的基本信息,一个数据帧。


Example

R 复制代码
library(paleobioDB)
library(RCurl)

options(RCurlOptions = list(cainfo = system.file("CurlSSL", "cacert.pem", package = "RCurl")))

pbdb_taxa (name="Canidae", vocab="pbdb", 
show=c("attr", "app", "size", "nav"))



  taxon_no orig_no record_type   rank taxon_name common_name
1    41189   41189       taxon family    Canidae       canid
   attribution     status parent_no reference_no is_extant
1 Fischer 1817 belongs to     36905         4783         1
  firstapp_ea firstapp_la lastapp_ea lastapp_la size extant_size
1    48.60000    40.40000    0.01170    0.00000  429         126
  parent_name parent_rank kingdom_no  kingdom phylum_no   phylum
1   Carnivora       order      67091 Animalia     33815 Chordata
  phylum_count class_no    class class_count order_no     order
1            0    36651 Mammalia           0    36905 Carnivora
  order_count family_no  family family_count genus_count
1           0     41189 Canidae            0          76

Page

R 复制代码
function (...) 
{
    l <- list(...)
    .pbdb_query("taxa/list", query = l)
}
相关推荐
nbsaas-boot1 小时前
Java 正则表达式白皮书:语法详解、工程实践与常用表达式库
开发语言·python·mysql
chao_7891 小时前
二分查找篇——搜索旋转排序数组【LeetCode】两次二分查找
开发语言·数据结构·python·算法·leetcode
风无雨2 小时前
GO 启动 简单服务
开发语言·后端·golang
斯普信专业组2 小时前
Go语言包管理完全指南:从基础到最佳实践
开发语言·后端·golang
我是苏苏3 小时前
C#基础:Winform桌面开发中窗体之间的数据传递
开发语言·c#
斐波娜娜4 小时前
Maven详解
java·开发语言·maven
小码氓4 小时前
Java填充Word模板
java·开发语言·spring·word
暮鹤筠4 小时前
[C语言初阶]操作符
c语言·开发语言
斜月三5 小时前
windows部署多实例filebeat监控相同路径下文件
windows·filebeat
Boilermaker19926 小时前
【Java EE】Mybatis-Plus
java·开发语言·java-ee