R语言【taxa】——taxa包中的类

Package taxa version 0.4.2


  • taxa_taxon-class

  • taxa_taxonomy-class

  • taxa_taxon_authority-class

  • taxa_taxon_db-class

  • taxa_taxon_id-class

  • taxa_taxon_rank-class


taxon

保存类群的基本信息,包括名称,等级和ID。

R 复制代码
taxon(name = character(0), rank = NA, id = NA, auth = NA, .names = NA, ...)

参数【name】:类群的名称。

参数【rank】:类群的等级。

参数【id】:类群的ID。

参数【auth】:类群的所有权。

参数【.names】:向量的名称。

参数【...】:其他参数。


taxon_authority

保存类群的所有权信息,包括作者名,日期和引用信息。

R 复制代码
taxon_authority(
author = character(),
date = "",
citation = "",
.names = "",
extract_date = TRUE
)

参数【author】:0或作者名。

参数【date】:0或日期。

参数【citation】:0或文献信息。

参数【.names】:向量的名称。

参数【extract_date】:为TRUE时(默认),如果在author中包括日期而date没有信息,那么将从author中提取date信息。


taxon_db

用来保存 db_ref 定义的类群数据库。

R 复制代码
taxon_db(db = character(), .names = NULL, ...)

参数【db】:0或类群数据库名称。

参数【.names】:向量的名称。

参数【...】:其余参数。


taxon_id

用来保存类群的ID。特别用来在 taxon 对象中保存类群ID。

R 复制代码
taxon_id(id = character(), db = "", .names = NULL)

参数【id】:0或类群ID。

参数【db】:ID 关联的数据库名称。

参数【.names】:向量的名称。


taxon_rank

保存类群的等级。特别用来在 taxon 对象中保存类群等级。

R 复制代码
taxon_rank(
rank = character(),
.names = NULL,
levels = NULL,
guess_order = TRUE
)

参数【rank】:0或分类等级名称。

参数【.names】:向量的名称。

参数【levels】:一种命名的数字向量,指示可能的分类等级的名称和顺序。较高的数字表示精细的分组。未知的等级可以用NA代替数字来表示。

参数【guess_order】:如果TRUE并且没有使用数字给出排名顺序,则尝试根据排名名称猜测顺序。

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