加载infercnv报错“../JAGS/modules-4/basemod.so”

woodman7182024-04-12 20:37

复制代码

 library(infercnv)
Error: package or namespace load failed for ‘infercnv’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rjags', details:
  call: load.module("basemod", quiet = TRUE)
  error: File not found: /opt/R/4.3.2/lib64/R/../JAGS/modules-4/basemod.so

一、 Plantform

系统：Rocky 9

R版本：4.3.2

infercnv:1.18.1

rjags:4-15

二、Schedule

1，安装教程

2，调用conda 环境报错，显然是路径问题，通过GPT、谷歌查找，使用下面两条命令，均无效

R 复制代码

Sys.setenv(JAGS_ROOT="/s1/Program/anaconda3/pkgs/jags-4.3.2-hb1d968a_0/lib")
dyn.load("/s1/Program/anaconda3/envs/public/lib/JAGS/modules-4/basemod.so")

3，方法总比困难多

bash 复制代码

# 在conda 环境中测试，调用infercnv正常。
# 使用find查找Rstudio 调用infercnv时，报错所示的文件。
cd /s1/Program/anaconda3
find ./ -type f -name "basemod.so"

mkdir -p /opt/R/4.3.2/lib64/JAGS/modules-4/
cd /opt/R/4.3.2/lib64/JAGS/modules-4/

# 根据find 找到的路径更改。
sudo ln -s /s1/Program/anaconda3/envs/public/lib/JAGS/modules-4/basemod.so basemod.so
sudo ln -s /s1/Program/anaconda3/envs/public/lib/JAGS/modules-4/bugs.so bugs.so