LLM生成模型在生物单细胞single cell的应用:scGPT

参考:

https://github.com/bowang-lab/scGPT

https://www.youtube.com/watch?v=XhwYlgEeQAs

相关算法:

主要是把单细胞测序出来的基因表达量的拼接起来构建成的序列,这里不是用的基因的ATCG,是直接用的基因名称

训练数据:scGPT全人模型是在3300万个正常人类细胞的scRNA-seq单细胞测向数据上进行预训练的。

输入文本序列就是单细胞测序出来的基因表达量的拼接;模型还是GPT基本架构

相关推荐
Young.Dr1 年前
1.如何修改seruat对象的行名 2.FeaturePlot如何把所有阳性表达的spot放到图的前面
单细胞测序