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前言
本文是在已有的代码基础上进行的开发,前期已经实现:
- ABI文件的解析
- 峰图的简单绘制
- svg绘图
对于1,主要用到之前重写的struct包,另外加一些适应ABI格式的修改,c#重写的struct参见:
c#-用c#重写python的struct包-简化版_c# struct pack-CSDN博客
https://blog.csdn.net/pxy7896/article/details/120055568
对于2,之前也写过一个很粗糙的python版,没什么用,后面会着重写绘制思路:
python-读取abi文件并绘制峰图_python abi如何获取-CSDN博客
https://blog.csdn.net/pxy7896/article/details/120562689
对于3,参考:
SVG 教程 | 菜鸟教程
https://www.runoob.com/svg/svg-tutorial.html
Blazor入门-简单svg绘制+导出图像_blazor 画图-CSDN博客
https://blog.csdn.net/pxy7896/article/details/139003443
由于项目还在进行中,所以先写一点占坑。。完全写好后会修改标题并去掉这一句🙂
问题描述
在生物学和测序领域中,ABI文件(ABI format)通常指的是Applied Biosystems(ABI)公司开发的测序数据文件格式,通常的文件扩展名为.ab1
。这是一种用于存储DNA序列或蛋白质序列测序结果的标准格式。
ABI文件包含了测序仪器产生的原始测序数据,包括碱基序列、测序质量值、电泳图谱等信息。这些数据对于进行基因组测序、DNA序列分析以及生物信息学研究非常重要。通常,科研人员会使用特定的软件或工具来处理和分析ABI文件,以获取目标DNA或蛋白质序列的信息。
(以上来自AI问答结果)
我现在接到的任务就是开发一个可以解析abi文件后绘制峰图的小工具。绘制效果应如下图所示:(其中,字体、颜色、间距等可以不同)