Linux中多线程压缩软件 | Mingz

原文链接:Linux中多线程压缩软件

本期教程

软件网址:

R 复制代码
https://github.com/hewm2008/MingZ

安装:

R 复制代码
git clone https://github.com/hewm2008/MingZ.git
cd MingZ
make
cd bin
./mingz -h

使用源码安装:

若是你的git无法使用安装,也可以只用源码安装。

R 复制代码
https://github.com/hewm2008/MingZ/releases/tag/v1.12

安装成功:

添加路径:

R 复制代码
vim ~/.bashrc
# 添加路径
PATH=$PATH:~/software/MingZ/bin

# 刷新一下~/.bashrc
source ~/.bashrc

使用:

R 复制代码
	Usage: mingz  big1.fq *.fq
	Options:
		-i   <str>   input of text file or pipe
		-o   <str>   output of text file
		-t           number of threads [4]
		-c           write on standard output
		-d           decompress(no threads)
		-h           show help hewm2008[v1.10]

例子:压缩

R 复制代码
	mingz  InA.fq  InB.fq  -o NewOutA.fq.gz   -o NewOutB.fq.gz 
	mingz *.fq   # will remove raw file out InA.fq.gz InB.fq.gz
	mingz  InA.fq  -t  10  # muti threads
	cat  InA.fq  | mingz  > NewOutA.fq.gz  ##    cat  InA.fq  | mingz  -o  NewOutA.fq.gz

解压:

R 复制代码
	mingz In.fq.gz -c -d  > new.Fq
	mingz -i In.Fa.gz -o  OutNew.fq  
	mingz *.gz -d   # will remove raw file

速度比拼:

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3. 转录组分析教程

4. 转录组下游分析

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