R语言详解predict函数

R语言中predict函数在建立模型,研究关系时常用。但是不同type得到的结果常常被混为一谈,接下来,探讨predict得到的不同结果。

复制代码
#数据
set.seed(123)
n<-1000
age<-rnorm(n,mean=50,sd=10)
gender<-rbinom(n,1,0.5)
disease<-rbinom(n,1,plogis(-3+0.05*age+0.5*gender))
data<-data.frame(age,gender,disease)

1、type="response"得到的时预测概率

复制代码
glm_model<-glm(disease~age,family=binomial(link="logit"),data=data)
a1=predict(glm_model,type="response")
print(a1[1:10])

2、type="link"得到log-odds (发生概率与不发生概率比值取自然对数)

复制代码
glm_model<-glm(disease~age,family=binomial(link="logit"),data=data)
a1=predict(glm_model,type="link")
print(a1[1:10])

3、type="terms"得到一个矩阵,给出线性预测量表上模型公式中每个项的拟合值。

复制代码
a3=predict(glm_model,type="terms")
print(a3[1:10])
相关推荐
A林玖11 小时前
【计算机相关学习】R语言
开发语言·学习·r语言
Yolo566Q19 小时前
R语言、BIOMOD2丨物种分布模型研究进展与挑战
r语言
岁月如歌,青春不败1 天前
MaxEnt模型全解析:从原理到 R 语言实战,开启生态环境研究新视野
arcgis·r语言·生态学·论文写作·生态系统服务·物种分布·maxent模型
invincible_Tang2 天前
R格式 (15届B) 高精度
开发语言·算法·r语言
KY_chenzhao2 天前
基于R语言与MaxEnt的物种分布建模全流程解析:从算法优化到科研制图实战
r语言·maxent·气候变化·物种分布
tRNA做科研2 天前
通过Bioconductor/BiocManager安装生物r包详解(问题汇总)
开发语言·r语言·生物信息学·bioconductor·biocmanager
Tiger Z2 天前
R 语言科研绘图 --- 韦恩图-汇总
开发语言·程序人生·r语言·贴图
Biomamba生信基地3 天前
R语言入门课| 04 R语言基本函数
开发语言·r语言·生信
十三画者3 天前
【工具】BioPred一个用于精准医疗中生物标志物分析的 R 软件包
数据挖掘·数据分析·r语言·数据可视化
小艳加油3 天前
MaxEnt物种分布建模全流程;R+ArcGIS+MaxEnt模型物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作
arcgis·r语言·物种分布模拟·maxent模型