Linux下编译安装METIS

本文记录Linux下编译安装METIS的流程。

零、环境

|---------|--------------------|
| 操作系统 | Ubuntu 22.04.4 LTS |
| VS Code | 1.92.1 |
| Git | 2.34.1 |
| GCC | 11.4.0 |
| CMake | 3.22.1 |

一、安装依赖

1.1 下载GKlib

复制代码
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install cmake

2.2 编译安装GKlib

下载GKlib代码,

复制代码
git clone https://github.com/KarypisLab/GKlib

按照下表完成CMake相关配置,构建项目,完成编译与安装。

|----------------------|---------------------------------|
| CMAKE_INSTALL_PREFIX | ~/dev/3rdparty/install/gcc-opt |
| CMAKE_BUILD_TYPE | Release |
| | |
| | |

二、编译安装

2.1 下载源码

复制代码
git clone https://github.com/KarypisLab/METIS.git

2.2 生成头文件

运行以下命令在生成build/xinclude目录

复制代码
make config shared=1 cc=icx prefix=~/dev/3rdparty/install/gcc-opt

2.3 编译

按照下表完成CMake相关配置,构建项目,完成编译与安装。

|----------------------|---------------------------------|
| CMAKE_INSTALL_PREFIX | ~/dev/3rdparty/install/gcc-opt |
| | |
| | |

附录I: cmake-tools-kits.json

复制代码
[
  {
    "name": "GCC 11.4.0 x86_64-linux-gnu",
    "compilers": {
      "C": "/usr/bin/gcc",
      "CXX": "/usr/bin/g++"
    },
    "isTrusted": true
  },
  {
    "name": "Intel(R) oneAPI DPC++/C++ Compiler 2024.2.1",
    "compilers": {
      "C": "/opt/intel/oneapi/compiler/2024.2/bin/icx",
      "CXX": "/opt/intel/oneapi/compiler/2024.2/bin/icpx"
    },
    "isTrusted": true
  }
]

网络

GKlibhttps://github.com/KarypisLab/GKlib

METIShttps://github.com/KarypisLab/METIS

相关推荐
KaMeidebaby13 小时前
卡梅德生物技术快报|PROTAC 药物降解蛋白原理及数据库平台开发全流程
前端·数据库·其他·百度·新浪微博
老陈头聊SEO15 小时前
生成引擎优化(GEO)助推内容创作和用户体验的有效策略与实践分享
其他·搜索引擎·seo优化
蓝狐社16 小时前
从牧高笛看露营装备业:增量不再,存量难吞
其他
ゆづき16 小时前
AI能否替代小说作家?
人工智能·笔记·学习·其他·生活
KaMeidebaby17 小时前
卡梅德生物技术快报|适配体筛选技术架构演进:SPARK-seq 高通量平台原理与技术流程解析
大数据·前端·其他·百度·架构·spark·新浪微博
KaMeidebaby2 天前
卡梅德生物技术快报|多肽库筛选:基于全质粒 PCR 的噬菌体文库构建与小分子表位淘选实战
前端·数据库·其他·百度·新浪微博
KaMeidebaby2 天前
卡梅德生物技术快报|噬菌体肽库展示技术构建 Mhp168‑Hsp70 定向随机肽库:流程、质控与数据结果
前端·数据库·其他·百度·新浪微博
Biocloudy2 天前
信号分子:从 CD8⁺ T 细胞到癌症免疫疗法
大数据·人工智能·经验分享·其他
拾光向日葵3 天前
在广东药科大学读书,课余生活与管理氛围观察
其他
KaMeidebaby3 天前
卡梅德生物技术快报|多肽库筛选技术构建药物递送功能肽库:流程、算法与质控体
前端·数据库·其他·百度·新浪微博