单细胞Seurat数据结构修改分群信息

单细胞转录组分群中,分群信息存储在Seurat数据结构的active.ident变量中。

如果要用自己表格中记录的细胞分群编号替换掉active.ident中的,可以:

cells1 <- names(xxx.Seurat@active.ident)

cells2 <- rownames(xxxTab)

先检查cells1和cells2细胞名是否都一致

替换操作:

xxx.Seurat@active.ident[cells2] <- factor(xxxTabcluster,levels = sort(unique(xxxTabcluster)))

然后使用DimPlot画图,可以看到分群信息已经变成自己表格记录中的了

相关推荐
六义义2 小时前
java基础十二
java·数据结构·算法
张张努力变强5 小时前
C++ 类和对象(四):const成员函数、取地址运算符重载全精讲
开发语言·数据结构·c++·后端
历程里程碑7 小时前
双指针 --- 接雨水
java·数据结构·python·算法·leetcode·职场和发展·tornado
Snow_day.7 小时前
【补题记录】AT441,442
数据结构·算法·贪心算法·动态规划·图论
DLGXY7 小时前
数据结构——栈(十六)
数据结构
Tim_108 小时前
【算法专题训练】38、二分查找算法
数据结构·算法
weixin_461769408 小时前
判断是否为素数
数据结构·c++·算法·素数
玉树临风ives9 小时前
atcoder ABC442 题解
数据结构·c++·算法
橘颂TA9 小时前
【剑斩OFFER】算法的暴力美学——力扣 542 .01 题:矩阵
数据结构·c++·算法·leetcode·职场和发展·哈希算法·结构与算法