单细胞Seurat数据结构修改分群信息

单细胞转录组分群中,分群信息存储在Seurat数据结构的active.ident变量中。

如果要用自己表格中记录的细胞分群编号替换掉active.ident中的,可以:

cells1 <- names(xxx.Seurat@active.ident)

cells2 <- rownames(xxxTab)

先检查cells1和cells2细胞名是否都一致

替换操作:

xxx.Seurat@active.ident[cells2] <- factor(xxxTabcluster,levels = sort(unique(xxxTabcluster)))

然后使用DimPlot画图,可以看到分群信息已经变成自己表格记录中的了

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