SPR 实验:分子互作检测 “金标准”,精准赋能药物靶点验证与药物发现

表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)技术作为分子间相互作用检测的金标准 ,是唯一被中、美、日三国药典同时收录的分子互作检测技术,凭借实时检测、无需标记、高灵敏高分辨率等核心优势,能精准解析分子互作的特异性、亲和力与动力学特征,成为药物靶点验证、药物发现过程中的关键技术手段,可高效确认靶蛋白功能与药物药理作用,加速药物研发进程。

一、SPR 技术核心原理:基于光学共振的分子互作动态监测

SPR 技术依托经典光学现象实现分子互作的定量检测,核心通过折射率变化关联生物分子结合行为,实现无标记的动态监测:

  1. 入射光以临界角入射至两种不同折射率的介质界面时,引发金属表面自由电子共振,电子吸收光能量使反射光强度大幅减弱;
  2. 当表面等离子波与消逝波共振时,反射光能量显著降低,此时对应的入射光入射角为SPR 角,共振波长为共振波长;
  3. SPR 角会随金属表面的折射率变化而改变,而折射率变化与结合在金属表面的生物分子质量成正比
  4. 通过捕获生物反应过程中 SPR 角的动态变化,可转化为生物分子间相互作用的特异性信号,实现分子互作的实时、定量分析。

二、SPR 标准实验步骤:四步完成,从样品处理到参数解析

SPR 实验流程标准化、自动化程度高,全程可实现高通量检测,核心分为固定配体、分析物进样、芯片再生、数据分析四个关键步骤,最终获得分子互作的核心动力学与亲和力参数:

  1. 固定配体:将待测分子(如蛋白质、抗体、核酸等)通过特定方法固定在金属薄膜修饰的传感芯片表面(如 CM5 芯片),形成稳定的配体固相表面,为分子结合提供基础;
  2. 分析物进样 :将含待检测分子的样品梯度浓度注入流动池,使其与芯片表面的固定配体接触;通过 SPR 专用仪器(如 Biacore 系列)实时监测分子结合、解离过程中的反射光强度变化,生成传感图
  3. 芯片再生:使用专用再生缓冲液清洗芯片表面,彻底洗脱未自发解离、仍结合于配体的分析物,使芯片表面恢复至初始状态;该步骤可重复进行,实现同一张芯片对多个化合物、多个浓度的连续检测;
  4. 数据分析 :通过专业软件分析传感图中反射光强度随时间的变化趋势,拟合计算得到分子互作的核心参数 ------结合常数(Ka)、解离常数(Kd)、亲和力常数(KD),其中 KD=Kd/Ka,是衡量分子结合强弱的关键指标。

三、SPR 技术核心特点:七大优势,成为分子互作检测首选

SPR 技术之所以能成为分子互作检测的 "金标准",核心源于其相较于传统检测方法的七大独特优势,全方位满足药物研发中分子互作检测的严苛需求:

  1. 实时动态检测 :全程追踪分子间结合 - 解离的完整过程,捕捉互作的动态变化细节,而非仅检测终点结果;
  2. 无需样品标记:避免荧光标签、生物素、同位素等标记物对分子结构和活性的干扰,最大程度保持分子天然状态,保证检测结果的真实性;
  3. 样品需求量低:芯片表面仅需约 50μg 蛋白即可完成检测,大幅降低珍贵样品(如重组靶蛋白、候选药物小分子)的消耗;
  4. 高效高通量 :检测过程以分钟为单位,仪器全自动运行,可同时实现多样品、多浓度的平行检测,提升实验效率;
  5. 高灵敏高分辨率 :可精准检测出弱相互作用的分子结合行为,对微量的分子结合引发的折射率变化实现精准捕捉,检测结果可靠性高;
  6. 应用范围广泛:无物种、分子类型限制,可检测蛋白、小分子、核酸、抗原、抗体、受体、配体等各类分子间的相互作用;
  7. 信息维度全面 :不仅能判断分子间是否存在相互作用 ,还可定量分析互作的特异性、亲和力、动力学特征,还能实现样品浓度的定量检测,一站式获取分子互作核心信息。

四、SPR 技术广泛应用范围:覆盖全类型分子互作检测

SPR 技术可实现任意两种可溶或固相化分子间的相互作用检测,适用于药物研发、分子生物学、免疫学等多个研究领域,核心应用场景包括:

  1. 蛋白与小分子间的相互作用(如药物小分子与靶蛋白的结合验证,药物研发核心环节);
  2. 蛋白与蛋白间的相互作用(如受体 - 配体、酶 - 底物、抗体 - 抗原、蛋白复合物组装);
  3. 核酸与蛋白间的相互作用(如转录因子与 DNA、RNA 结合蛋白与 RNA、核酸适配体与靶蛋白);
  4. 核酸与核酸间的相互作用(如 DNA 双链杂交、miRNA 与靶 mRNA 结合);
  5. 经典抗原 - 抗体分子相互作用(如抗体亲和力筛选、抗原表位鉴定);
  6. 受体 - 配体间分子相互作用(如细胞表面受体与可溶性配体、激素与受体的结合分析)。

五、SPR 技术提供的核心分子互作信息:三维度解析,精准量化互作特征

SPR 技术通过对传感图的拟合分析,可从特异性、亲和力、动力学三个核心维度,实现分子间相互作用的全面、定量解析,为药物靶点验证和药物筛选提供关键数据支撑:

  1. 特异性分析 :明确目标分子与靶分子之间是否存在特异性结合,排除非特异性结合的干扰,确认分子互作的靶向性(如候选药物是否仅与靶蛋白结合,而非其他杂蛋白);
  2. 亲和力测定 :通过计算亲和力常数(KD),定量判断两种分子之间的结合强弱,KD 值越小,分子结合越紧密,亲和力越高;
  3. 动力学分析 :通过结合常数(Ka)、解离常数(Kd),分析两种分子结合和解离的速率快慢------Ka 越大表示结合速率越快,Kd 越小表示解离速率越慢,二者共同决定分子结合的稳定性。

六、药物靶点 SPR 验证经典应用案例:直接佐证分子结合,赋能药物研发

SPR 技术是药物靶点验证的核心技术手段,可直接定量检测候选药物分子与靶蛋白的结合亲和力,为靶点确证、先导化合物筛选提供直接的实验证据,以下为两个典型应用案例:

案例 1:小分子 GBA 与靶蛋白 CNPY3 的结合验证

通过 Biacore T200 系统检测 GBA 与 CNPY3 的相互作用,结果显示二者的亲和力常数KD=278nM ,表明 GBA 与 CNPY3 之间存在强相互作用 ,直接确证 CNPY3 为 GBA 的潜在作用靶点。实验关键细节:CM5 芯片经 N - 羟基磺基琥珀酰亚胺活化后,将 40μg/mL 的重组人 TPI 蛋白用 pH4.5 乙酸稀释后偶联于芯片,乙醇胺封闭未结合位点;梯度浓度 GBA 以 30μL/min 流速注入含 0.05% Tween 20、5% DMSO 的 PBS 运行缓冲液,Biacore T200 软件分析数据。

案例 2:化合物与靶蛋白 DCTPP1 的结合特异性与亲和力筛选

通过 Biacore S200 系统在 25℃下检测,结果显示化合物 2 与 DCTPP1 的亲和力常数KD=3.8μM ,存在显著结合;而化合物 13、15 作为对照,与 DCTPP1 未显示出显著结合,明确了化合物 2 对 DCTPP1 的结合特异性与亲和力。实验关键细节:采用胺偶联法将重组人 DCTPP1 蛋白固定于活化的 CM5 芯片;梯度浓度化合物 2 以 30μL/min 流速注入含 5% DMSO 的 PBS・P 运行缓冲液;数据拟合至 1:1 朗缪尔结合模型,Biacore S200 软件推导动力学参数。

七、分子互作亲和力(KD)判定标准:按结合类型划分,精准解读 KD 值意义

不同类型分子间的天然结合亲和力存在显著差异,需结合分子结合类型判断 KD 值对应的结合强弱,以下为各类分子互作的经典 KD 值范围参考,为实验结果解读提供依据:

  • 亲和素 - 生物素结合:10⁻¹⁴ M(极强结合,不可逆结合);
  • 强的抗原 - 抗体结合、DNA 与蛋白的结合:10⁻⁸ ~ 10⁻¹⁰ M(高强度结合,稳定性高);
  • 较弱的抗原 - 抗体结合:10⁻⁶ ~ 10⁻⁷ M(中强度结合,存在一定解离);
  • 酶与底物结合:10⁻⁴ ~ 10⁻¹⁰ M(结合跨度大,与酶促反应效率相关);
  • 蛋白与小分子结合(药物研发核心类型):10⁻³ ~ 10⁻⁶ M(常规有效结合范围,是药物小分子与靶蛋白的典型亲和力区间)。
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