复现cvt2distilgpt2过程
一、切换目录并clone代码：cd /lishnai28/lcs/lcs/
git clone https://github.com/aehrc/cvt2distilgpt2.git
cd cvt2distilgpt2
二、创建虚拟环境并激活：
conda create -n cvt2 python=3.8 -y
conda activate cvt2
三、具体操作：
1，更新pip包管理器：pip install --upgrade pip
（虚拟环境中python -m pip install --upgrade pip和pip install --upgrade pip的行为一致。若当前存在多个python版本和虚拟环境，使用python -m 可以显式指定使用当前激活的python解释器，更安全）
2，安装依赖：pip install --upgrade -r requirements.txt --no-cache-dir
3，权重文件准备
两个模型检查点下载并上传（下载地址------https://doi.org/10.25919/ng3g-aj81）
chexbert.pth从源目录复制：cp /lishnai28/lcs/lcs/CheXbert/src/chexbert.pth /lishnai28/lcs/lcs/cvt2distilgpt2/checkpoints/stanford/chexbert/
4，数据集选择直接切换目录不再重复粘贴
mimic-cxr-jpg：/lishnai28/lcs/lcs/mimic_cxr/images/
mimic-cxr标签（对应的annotations.json）：/lishnai28/lcs/lcs/mimic_cxr/annotation.json
iu_xray images：/lishnai28/lcs/lcs/iu_xray/images/
iu_xray annotations：/lishnai28/lcs/lcs/iu_xray/annotation.json
5，运行测试
dlhpcstarter -t iu_x_ray_chen -c config/test_iu_x_ray_chen_cvt2distilgpt2.yaml --stages_module stages --test
dlhpcstarter -t mimic_cxr_chen -c config/test_mimic_cxr_chen_cvt2distilgpt2.yaml --stages_module stages --test
解决报错：
1，下载CvT-21 检查点"/lishnai28/lcs/lcs/cvt2distilgpt2/checkpoints/microsoft/CvT/CvT-21-384x384-IN-22k.pth"（https://github.com/microsoft/CvT）
DistilGPT2 检查点"/lishnai28/lcs/lcs/cvt2distilgpt2/checkpoints/distilgpt2/"（https://huggingface.co/distilbert/distilgpt2）
测试指标复现成功√、下边是对应修改后的代码文件
6，模型训练
dlhpcstarter -t iu_x_ray_chen -c config/train_iu_x_ray_chen_cvt2distilgpt2.yaml --stages_module stages --train --test
dlhpcstarter -t mimic_cxr -c config/train_mimic_cxr_chen_cvt2distilgpt2.yaml --stages_module stages --train --test
git-lfs在Linux 下正确的安装与初始化命令（pip不管用）：
++# 1. 安装 git-lfs
conda install -c conda-forge git-lfs++
++# 2. 初始化 git-lfs (这会在你的 ~/.gitconfig 中写入必要的全局配置)
git lfs install++