Biome-BGC模型应用

Biome-BGC是一款高效的生态系统过程模型,可结合站点描述、气象及植被生理生态参数,实现日尺度碳、水、氮通量模拟,研究尺度可从点尺度扩展至整个陆地生态系统。该模型可系统模拟碳积累、水分输运、土壤过程及能量平衡等核心生态过程。重点讲授利用CMFD和CN05.1格点化气象数据驱动该模型开展区域模拟,并介绍Linux、Python等工具在模型前处理与后处理中的综合应用。

第一部分、模式讲解

Biome-BGC 介绍

第二部分、课程基础

Linux应用

实现批量创建文件、删除文件及文件夹

并行化执行程序

CDO工具应用

使用cdo工具对netCDF文件进行合并

筛选时间和变量 裁剪为 小区域

Python应用

Python的循环语句,逻辑语句,

创建N umpy数组,并统计计算;

使用Matplotlib制作散点图、等值线图;

利用零散数据P andas创建数,制作时间

利用X array读取netCDF文件,写入netCDF文件;实现插值工作

第三部分、数据处理

在linux 上综合使用cdo和xarray数据制备所需数据。

1、静态数据制备:

地形数据:GTOPO 30 S 1 km

土地利用数据:GLCC 1 km

土壤数据:FAO

GPP数据:MODIS数据

2、驱动数据制备:

CN 05 . 1 数据处理

CMFD 数据处理

3、生态数据

MODIS GPP

第四部分、单点的模拟

1、前处理

从空间格点数据(netCDF格式)插值到站点

配置Biome-BGC运行文件

制备用于驱动Biome-BGC的气象数据

2、运行BGC模型

3、调参

以MODIS的GPP产品为观测值,使用Python库并行化调整Biome-BGC模型的参数

调整生长季开始和结束

4、后处理

读取Biome-BGC的ascii文件和二进制文件

结果统计计算

结果可视化

第五部分、区域模拟-1****

区域模拟是将区域上每个格点分别进行计算进行的。在本节案例中,将以一个较小的省份进行高分辨率模拟和在中国进行粗分辨率模拟。模拟过程中涉及以下步骤:

静态地理数据准备

气象驱动数据制备

分配数据

并行运行

合并单点结果为空间数据

第六部分、长时间序列模拟案例

使用ERA5作为观测数据的降尺度后的CMIP6未来气候变化降尺度数据。

对气象数据降尺度,获得气温、湿度、降水和向下短波辐射。

土壤数据、植被数据库查询

准备气象数据和静态数据

后处理模拟结果数据

第七部分、分析

在单点和空间模拟数据的基础上,进行以下分析:

敏感性分析:

使用敏感性分析方法( SAL ib库),分析主要模拟参数对GPP的影响

归因分析:

使用通径分析方法( semopy 库),结合气象要素,分析对GPP和ET的影响过程

需要硬件基础要求

CPU: 8核心16线程及以上(空间模拟需要计算资源)

内存: 16G及以上

硬盘: 计算机本地硬盘100GB及以上(虚拟机+数据的存储)

在课程前,将协助部署配置VirtualBox虚拟机(Python的运行环境)

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