安装EnsDb.Hsapiens.v86

拜托啦！狮子2026-04-26 11:43

用conda无法进行，用BiocManager::install也不行，只能尝试本地安装，但是如果直接用

R 复制代码

# 设置包路径
path <- "/home/myy/EnsDb.Hsapiens.v86_2.99.0.tar.gz"

# 安装到你刚建的本地目录 ~/R_libs
install.packages(path, repos = NULL, type = "source")

也无法安装，因为我的R包会被安装到网络盘/mnt中，因为我实际上的conda路径是在这个网络盘，而EnsDb是一个SQLite 数据库，网络波动或挂载点失效等问题会导致进程卡死在磁盘I/O上，只能用kill -9 ID杀死处于D状态的进程。

因此只能将该包安装到/home下，即

R 复制代码

# 设置包路径
path <- "/home/myy/EnsDb.Hsapiens.v86_2.99.0.tar.gz"

# 先建立一个本地库目录
dir.create("~/R_libs", showWarnings = FALSE)

# 安装到本地
install.packages(path, repos = NULL, type = "source", lib = "/home/myy/R_libs")

它会在/home/myy/R_libs目录下安装上EnsDb这个包，导入时也只能用

R 复制代码

# 告诉 R 你的私房库路径
library(EnsDb.Hsapiens.v86, lib.loc = "/home/myy/R_libs")

要写到EnsDb.Hsapiens.v86目录所在的上一级目录，如 library(EnsDb.Hsapiens.v86, lib.loc = "/home/myy/R/x86_64-conda-linux-gnu-library/4.3/")