产品介绍 | HEBER-seq，开启cfRNA液体活检新时代！
HEBER-seq
开启exRNA液体活检新时代
技术应用
送样要求
样本类型：
血浆，尿液 ，脑脊液等体液样本
**建议起始样本量：**30例 VS 30例
技术优势
-
样本要求量低，适用样本类型丰富
-
无需富集胞外囊泡，减少过程损失，灵敏度高
-
去rRNA建库，同时获得mRNA和IncRNA数据
-
自动化高通量建库，缩短一半以上时间，快捷高效
-
充分发挥深度学习算法的优势，多靶点提高诊断性能
分析内容
-
去接头污染，去低质量reads 和测序质量评估
-
参考基因组比对
-
全基因组reads 分布图谱
-
mRNA表达差异分析
-
差异基因KEGG、GO 分析
-
差异lncRNA 分析
高级分析内容
-
组织特异性分析
-
WGCNA分析/GSEA分析
-
建立疾病诊断/预后评估模型
-
IPA通路分析
分析内容示例
图1.不同样本类型所测得的基因数量
图2.Coeff模型分析
图3.ROC分析training数据集
图4.疾病靶基因IPA分析
参考文献
1\] Ngo TTM, Moufarrej MN, Rasmussen MH, et al. Noninvasive blood tests for fetal development predict gestational age and preterm delivery. ：Science 2018 Jun 08;360(6393) . \[2\] Chalasani N, Vuppalanchi R, Lammert C, et al. Circulating cell-free messenger RNA secretome characterization of primary sclerosing cholangitis. medRxiv preprint. August 23, 2022. [\[3\] Rasmussen M, Reddy M, Nolan R, et al. RNA profiles reveal signatures of future health and disease in pregnancy. Nature2022Jan;601(7893). （点击阅读文章解读）](http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyNDY2NDM1Mg==&mid=2247490544&idx=1&sn=e7691821f52fa87a6ecf863db7107220&chksm=e80ad5bfdf7d5ca904301c4bb4ebe98d18fb5eda5816985b8cc7c7256c995ff970837e585881&scene=21#wechat_redirect "[3] Rasmussen M, Reddy M, Nolan R, et al. RNA profiles reveal signatures of future health and disease in pregnancy. Nature2022Jan;601(7893). （点击阅读文章解读）") \[4\] Vorperian SK, Moufarrej MN; Tabula Sapiens Consortium, et al.Cell types of origin of the cell-free transcriptome.Nat Biotechnol. 2022 Jun;40(6):855-861. **欢迎拨打400-775-0875**