HEBER-seq，开启cfRNA液体活检新时代！

产品介绍 | HEBER-seq，开启cfRNA液体活检新时代！

HEBER-seq

开启exRNA液体活检新时代

技术应用

送样要求

样本类型：

血浆，尿液 ，脑脊液等体液样本

**建议起始样本量：**30例 VS 30例

技术优势

1. 样本要求量低，适用样本类型丰富

2. 无需富集胞外囊泡，减少过程损失，灵敏度高

3. 去rRNA建库，同时获得mRNA和IncRNA数据

4. 自动化高通量建库，缩短一半以上时间，快捷高效

5. 充分发挥深度学习算法的优势，多靶点提高诊断性能

分析内容

1. 去接头污染，去低质量reads 和测序质量评估

2. 参考基因组比对

3. 全基因组reads 分布图谱

4. mRNA表达差异分析

5. 差异基因KEGG、GO 分析

6. 差异lncRNA 分析

高级分析内容

1. 组织特异性分析

2. WGCNA分析/GSEA分析

3. 建立疾病诊断/预后评估模型

4. IPA通路分析

分析内容示例

图1.不同样本类型所测得的基因数量

图2.Coeff模型分析

图3.ROC分析training数据集

图4.疾病靶基因IPA分析

参考文献

1 Ngo TTM, Moufarrej MN, Rasmussen MH, et al. Noninvasive blood tests for fetal development predict gestational age and preterm delivery. ：Science 2018 Jun 08;360(6393) .

2 Chalasani N, Vuppalanchi R, Lammert C, et al. Circulating cell-free messenger RNA secretome characterization of primary sclerosing cholangitis. medRxiv preprint. August 23, 2022.

3 Rasmussen M, Reddy M, Nolan R, et al. RNA profiles reveal signatures of future health and disease in pregnancy. Nature2022Jan;601(7893). （点击阅读文章解读）

4 Vorperian SK, Moufarrej MN; Tabula Sapiens Consortium, et al.Cell types of origin of the cell-free transcriptome.Nat Biotechnol. 2022 Jun;40(6):855-861.

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