自AAV2首次被克隆以来，AAV血清型家族不断扩大。不同血清型的衣壳蛋白结构差异导致其与细胞受体的结合能力不同，从而赋予病毒特异性的器官靶向能力。重组AAV（如rAAV2/9）采用AAV2基因组配合其他衣壳，既能稳定表达，又能实现组织特异性感染。下列方案及数据来源和元生物，供研究参考。
（图片来源：和元生物）
靶向肠道的AAV血清型：
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AAV9：肠系膜上动脉注射、灌肠、结肠内注射
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AAV8：肠系膜上动脉注射
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AAVrh10：肠系膜上动脉注射
启动子选择：
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广泛感染启动子：CBh、CMV、CAG、EF1α、U6
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肠上皮细胞：Villin
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肠杯状细胞：MUC2
注射方式参考：
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肠系膜上动脉注射：AAV9、AAV8、AAVrh10 ~1E+11 vg/只
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灌肠：AAV9 ~1E+11 vg/只
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结肠内注射：AAV9 ~1E+11 vg/只