dMRI phase encoding字段对应关系

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  • [BIDS PE 符号](#BIDS PE 符号)
    • [fslhd axis orientation](#fslhd axis orientation)

BIDS PE 符号

BIDS 里的 i/j/k 用来描述 phase encoding 发生在哪一个 NIfTI 数据轴 上;它们不是固定的解剖方向缩写,因此不能直接等同于 LR/AP/SI。

fslhd axis orientation

fslhd axis orientation Positive BIDS Negative BIDS
xorient Right-to-Left i = RL i- = LR
xorient Left-to-Right i = LR i- = RL
yorient Anterior-to-Posterior j = AP j- = PA
yorient Posterior-to-Anterior j = PA j- = AP
zorient Inferior-to-Superior k = IS k- = SI
zorient Superior-to-Inferior k = SI k- = IS

所以不能全局写死 AP = j, PA = j-。正确做法是先读取每个 NIfTI 的 orientation,再把 BIDS i/j/k 翻译成解剖方向。

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