eDNA常用的基因片段

脊椎动物主要有什么基因组?

对脊椎动物而言,主要有两套基因组:

如果扩展到其他生物,植物和许多藻类还有叶绿体(质体)基因组,因此通常具有核、线粒体和叶绿体三套基因组。

细菌没有细胞核,也没有线粒体;其遗传信息主要位于细菌染色体 ,部分还具有独立的质粒。

与你的eDNA研究相关的标记可以这样区分:

  • 12S、动物线粒体16S、COI:来自线粒体基因组。
  • 18S、ITS :来自真核生物的核基因组。
  • 植物trnL、rbcL、matK:来自叶绿体基因组。

注意:细菌16S与动物线粒体16S不是同一个检测对象,虽然名称相似,但使用的引物和监测类群不同。


线粒体基因组由哪些基因片段组成?

脊椎动物 中,典型线粒体基因组由 13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因、22个转运RNA基因,以及非编码区域组成。

COI 属于蛋白质编码基因 、12S rRNA、16S rRNA属于核糖体RNA基因 。


常用脊椎动物基因片段的长度

脊椎动物线粒体完整的基因序列,其长度:

常用的脊椎动物引物

数据库选择

相关推荐
前进的李工6 小时前
Agent 学习笔记 05:系统提示词应该怎么写
笔记·学习·prompt·agent·个人开发·few-shot·ai应用开发
蒸蒸yyyyzwd8 小时前
后端学习笔记三个知识
笔记·八股
Zhao-Jichao10 小时前
AI Prompting for Everyone 课程笔记 - P19 数据分析 Data Analysis
人工智能·笔记·数据分析
旖旎夜光10 小时前
【C++ 基础入门】类和对象(上):封装、对象模型与 this 指针
开发语言·c++·笔记·学习
ACP广源盛1392462567311 小时前
选型笔记:Type‑C 扩展坞方案评估|DP1.2 转 HDMI2.0 桥接芯片 GSV2201D@ACP
笔记·硬件架构·硬件工程·视频·国产芯片
李长渊哦12 小时前
Qoder 自定义子智能体(Subagent)学习笔记
chrome·笔记·学习
pixelpilot12 小时前
Deta Surf:把笔记、文件和网页塞进同一个 AI 工作台
笔记·其他
蒸蒸yyyyzwd13 小时前
学习笔记 复盘
笔记·八股
旖旎夜光13 小时前
【C++ 基础入门】命名空间、输入输出、缺省参数与函数重载
开发语言·c++·笔记·学习
一支蜉蝣16 小时前
Day26 XD安全学习笔记--PHP 应用&模版引用&Smarty渲染&MVC 模型&数据联动&RCE 安全
笔记·网络安全·html·php