非靶向代谢组学能够广泛检测样本中的代谢特征，为探索代谢变化与生物学机制提供重要线索。然而，在实际研究中，化合物注释仍面临一定挑战：
仅依赖公共数据库匹配，往往难以充分区分结构相近的候选化合物；对于缺乏标准品实测信息的注释结果，其鉴定依据也存在一定局限。
如何为代谢物注释提供更直接、更充分的实验证据，成为提升非靶向代谢组学结果可信度的重要方向。
基于此，派森诺生物推出【精谱代谢组】，产品以自建标准品实测数据库为核心特色，将标准品保留时间、一级质谱及二级质谱等多维信息应用于化合物注释，为代谢物鉴定提供更有力的证据支持，助力科研人员更有依据地解读代谢组学数据。
一、标准品实测数据库：多维证据支持代谢物注释
为规范代谢物鉴定与注释，国际代谢组学标准倡议（MSI）于2007年提出代谢物鉴定分级框架，相关研究于2014年进一步探讨了注释与鉴定结果的报告规范。基于多维证据支持鉴定结果的理念，派森诺精谱代谢组建立三级注释体系，根据证据来源与完整程度对注释结果进行分级，帮助研究人员更直观地理解化合物注释依据与可信度差异。
二、代谢组数据库全新升级：PSNGM_V1至PSNGM_V2
派森诺生物PSNGM_V1数据库自2024年上线以来持续服务于代谢组学研究与项目实践，已发表文章250+篇，其中提到或致谢PSNGM库的文章有120+篇。持续积累的科研应用成果，见证了PSNGM_V1数据库的建设历程，也为数据库的进一步迭代奠定了基础。数据库建设并非一蹴而就，面对不断增长的代谢物鉴定需求，数据库需要持续扩充标准品实测数据、更新公共数据库资源，基于持续的建设与积累，PSNGM_V1数据库正式升级至V2版本。
同时，不同样本具有不同的物质组成和代谢特征。若不考虑样本背景，仅依赖通用数据库进行检索，可能产生大量与研究对象关联较弱的候选结果。派森诺非靶向代谢组构建七大样本类型专属数据库，根据不同样本类型的特点，为化合物注释提供更具针对性的资源支持。标准品实测数据库、公共数据库和样本类型专属数据库各有侧重。精谱代谢组通过多类资源的协同应用，进一步完善代谢物注释的数据基础，支持不同研究方向的分析需求。
三、真实样本评估：检验实际注释表现
数据库建设的价值，最终需要通过真实样本数据进行检验。精谱代谢组结合不同样本类型、不同研究项目的实测数据，从标准品支持的 Level 1 注释结果与总体代谢物检出情况两个维度开展统计分析，评估不同样本类型专属数据库在实际项目中的应用表现，实测数据显示，跨多样本类型Level1鉴定数量500+~1300+。
四、丰富的生信分析体系：从代谢物注释到结果解读
获得代谢物注释结果只是非靶向代谢组学研究的起点，如何进一步识别样本间差异、观察整体变化趋势，并探索潜在的生物学关联，同样影响研究结果的呈现与解读。在代谢组学数据分析方面，派森诺生物已建立成熟的生信分析流程，可结合项目设计与研究目的，提供多层次的数据分析与结果展示。
五、多维数据质控：贯穿实验与分析全流程
可靠的代谢组学结果，离不开规范的实验质控与严谨的数据质控。派森诺生物从实验质控和数据质控两个维度出发，通过实验过程中的质量监测与数据分析阶段的质量评估，关注样本检测稳定性、数据重复性及整体数据质量，为后续代谢物注释、差异分析与研究结果解读提供可靠的数据基础。
六、队列专属算法：拓展大规模代谢组学研究应用
面向大规模队列研究需求，派森诺生物开发了专属分析算法，为队列代谢组学数据分析提供技术支持。依托已完成的多项千例规模队列研究项目，派森诺生物在大规模样本分析实践中持续沉淀经验，助力探索代谢特征与表型之间的潜在关联
左：校正前 右：校正后
上：校正前 下：校正后
精谱代谢组产品亮点
- 自建标准品实测数据库，对齐国际标准；
- 七大样本类型专属数据库，匹配不同研究需求；
- 多维质控体系，覆盖实验过程与数据分析全流程；
- 70+生信分析图例，支持深度数据挖掘；
- 队列研究专属算法，助力大规模队列数据分析。
结语
精谱代谢组围绕标准品实测数据库、公共数据库、七大样本类型专属数据库及成熟生信分析能力进行整合，进一步完善代谢物注释与数据解读的技术支持体系。从多维质谱证据到样本类型适配，从注释结果评估到后续生信分析，派森诺生物持续关注代谢组学数据的可解释性与实际研究价值，助力科研人员更深入地探索代谢变化，为科学研究提供有力支持。
供稿 | 蛋白代谢产品部
编辑 | 市场部