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肿瘤

Tiger Z
11 天前
文献阅读·肿瘤·单细胞空间组·生信工具
文献阅读 | Nat Commun | 从空间转录组数据估计肿瘤中的细胞谱系文献题目: 从空间转录组数据估计肿瘤中的细胞谱系 研究团队: Peng Jiang(美国国家癌症研究所) 发表时间: 2023-02-02 发表期刊: Nature Communications 影响因子: 16.6(2023年) DOI: 10.1038/s41467-023-36062-6
生信小鹏
3 个月前
单细胞测序·单细胞空间组学·肿瘤
空间转录组主流技术对比与华大Stereo-seq深度解析👋 如果本文对你有帮助,欢迎点赞、收藏这段时间在处理/对接 空间转录组(ST) 数据,也顺手把相关技术路线做了一次系统梳理。空间转录组看似“一个赛道”,实际包含两条完全不同的技术范式:测序型 与 成像型。而不同平台在“分辨率—通量—样本类型—成本—下游分析复杂度”之间的取舍差异,往往决定了你最后能回答什么问题。 本文以“笔记型”的方式,把主流技术做一个全景对照学习,并重点对 Stereo-seq 的数据结构做拆解学习。
我是有底线的