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Blockbuater_drug
1 小时前
agent·mcp·proteinmpnn·rfdiffusion·esmfold·boltz-2
protein-design-mcp 裸机实战:41 个蛋白设计工具大合集Agent部署与实测本文收录于专栏 AI Agent智能体系列 —— 专栏系统覆盖 AI Agent 工具链、MCP 与蛋白质设计自动化实战,点击订阅可跟踪后续更新。
Blockbuater_drug
6 天前
蛋白质设计·proteinmpnn·prosculpt·rfdiffusion·固定骨架重设计·蛋白设计流水线
Prosculpt:一个 YAML 文件串起 RFdiffusion 全流程——蛋白设计流水线本地部署与实测本文收录于专栏 开源蛋白生成方法实践 —— 专栏系统覆盖开源蛋白/抗体设计与生成方法实战,点击订阅可跟踪后续更新。
Blockbuater_drug
22 天前
微调·cyclicmpnn·环肽序列设计·proteinmpnn·highfold·序列多样性
CyclicMPNN: 环肽序列设计专用模型——ProteinMPNN 的环肽微调版你用 RFPeptide 或 GenKIC 生成了一堆环肽骨架,却卡在序列设计这步——通用 ProteinMPNN 的训练集几乎全是球蛋白,给短环肽配的序列折叠成功率不高;本文给你俄勒冈大学团队 2026 年推出的 CyclicMPNN:在环肽专用数据上微调 ProteinMPNN,架构零改动,8 残基环肽的中位骨架 RMSD 从 1.55 Å 降到 1.13 Å,motif inpainting 稳定序列数量约翻倍;本文附本地实测:纯 CPU 0.35 秒出 8 条序列,多样性优势当场复现(成对差异 4
我是有底线的