[Gromacs]核心性能梯度测试:GROMACS 多线程性能调优实验笔者在进行Gromacs动力学模拟时发现,当我们将线程数设置成最大CPU线程数时,性能反而不如减少25%线程时候性能高,大概率是线程过高通信开销过大,因此设计了这个实验来验证笔者的想法与寻找最优线程数。分子动力学(MD)模拟中,我们需要设置并行线程数对计算效率非常重要。我们实验在一台配备 AMD Threadripper PRO 5945WX(12 物理核心,24 逻辑核心)和 NVIDIA RTX 4090 GPU 的工作站上,测试了 GROMACS 2024.6 在不同 OpenMP 线程数(10~2