「自兹以往」动物肠道微生物组动物肠道微生物组由细菌、古菌、真菌、病毒与原生生物共同构成,是宿主演化、生理稳态及生态系统稳定性的关键基础。本文综述21世纪全动物类群肠道微生物组在物种多样性、时空分布规律与生理功能方面的研究进展。高通量宏基因组技术推动本领域快速发展,但现有研究存在明显采样偏倚:研究对象多集中于家养脊椎动物与粪便样品,野生动物、无脊椎动物及非细菌类群中仍存在大量未探明的「微生物暗物质」。本文系统阐述肠道微生物介导宿主适应低氧、温度胁迫、外源毒素等极端环境的作用,以及工业化活动破坏共生菌群、加剧生物多样性衰减与动物患病风险