结构生物学

课前准备--3D-QSAR与药物结构优化3D-QSAR（Three-Dimensional Quantitative Structure–Activity Relationship，三维定量构效关系）的核心思想，是把一系列具有相似作用机制的活性化合物放到统一的三维空间中，分析分子不同空间位置的立体场、静电场等性质与生物活性之间的定量关系，再利用模型预测新化合物活性，从而指导药物结构优化。

课前准备--分子动力学Gromacs参数的详细介绍与选择（一）对于 GROMACS 分子动力学（MD），真正难的不是记住命令，而是理解 .mdp 参数为什么这么选、不同参数之间有什么关系，以及什么情况下应该改参数。

课前准备--蛋白建模AlphaFold 2与AlphaFold 3可以把 AlphaFold 2（AF2）理解成蛋白质结构预测领域一个非常重要的分水岭。它真正厉害的地方并不是简单地“输入氨基酸序列 → 输出三维结构”，而是把进化信息（MSA）+ 残基对关系（pair representation）+ 深度注意力网络（Evoformer）+ 几何约束（Invariant Point Attention）+ 迭代优化（recycling）整合成了一个端到端结构预测系统。

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Alphafold实用指南—官网教程3承接上一篇博客：https://blog.csdn.net/weixin_62528784/article/details/155135250?spm=1001.2014.3001.5502

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结构生物学3-冷冻电镜单颗粒重构：第3章和第4章区别在于用冷冻电镜还是用x射线来解析结构1，单颗粒冷冻电镜：可参考第1章绪论2，emdataresource

我是有底线的